R语言 methVisual包 plotAbsMethyl()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotAbsMethyl(methVisual)
plotAbsMethyl()所属R语言包：methVisual

                                        Plot number mathylation on CpGs positions
                                         图上的CPGs职位数量mathylation

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plot of absolute/relative number of mathylation on aligned CpGs positions   
图绝对/相对mathylation数量的位置上对齐的CPGs


用法----------Usage----------


plotAbsMethyl(methData,real)



参数----------Arguments----------

参数：methData
List; contains information on the pairwise alignments, and methylated CpG motifs.
名单包含成对的路线，和甲基化的CpG基序的信息。


参数：real
real position (real=TRUE) or relative position (real=FLASE) on reference sequence
实际位置（实际= TRUE），或参考序列的相对位置（实际= FLASE）


Details

详情----------Details----------

This function generates a plot of the absolute number of methylation in all CpG sites over all examined sequences. It returns a vector with the absolute number of methylation sites of all examined clone sequences. The user supplies a list object containing information about the pairwise alignments, and methylated CpG sites as calculated by MethAlignNW() or makeDataMethGFF().  The user can display the absolute number of methylation over the CpG sites according to their relative position on the reference sequence.
这个函数生成一个绝对数量在检查了所有序列的所有CpG位点甲基化的图。它返回一个向量，所有被检测的克隆序列的甲基化位点的绝对数量。用户提供约成对的路线，和的MethAlignNW（）或makeDataMethGFF（）计算的甲基化的CpG位点的一个列表对象包含的信息。用户可以根据他们的参考序列上的相对位置，显示在CpG位点甲基化的绝对数量。


值----------Value----------

A vector with the absolute/relative number of methylation on genomic sequence CpG positions over all examined sequences
对所有检查序列甲基化的基因组序列的CpG位置上的绝对/相对数的向量


作者（S）----------Author(s)----------


Arie Zackay <arie.zackay@mail.huji.ac.il>, Christine Steinhoff <steinhof@molgen.mpg.de>



举例----------Examples----------


## using methData[＃methData]
data(methData)
plotAbsMethyl(methData,real=FALSE)

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注：
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