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methWhitneyUTest(methVisual)
methWhitneyUTest()所属R语言包：methVisual

                                        Mann Whitney U-Test on methylation data
                                         甲基化数据的Mann Whitney U检验

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Mann Whitney U-Test on entire sets of CpG sites
CpG位点的整个集的Mann Whitney U检验


用法----------Usage----------


methWhitneyUTest(methData,set1,set2)



参数----------Arguments----------

参数：methData
List; contains information on the pairwise alignments, and methylated CpG motifs.
名单包含成对的路线，和甲基化的CpG基序的信息。


参数：set1
First subset - Integer vector of experiments due to there order at methData
第一子集 - 由于实验的整数向量有在methData订购


参数：set2
Second subset - Integer vector of indexes of experiments due to there order at methData
第二子集 - 整数向量实验指标由于有在methData订购


Details

详情----------Details----------

Mann Whitney U-Test (known also as wilcoxon-rank-sum test), is a non parametric test for assessing whether two independent samples of observations come from the same distribution. The null hypothesis in the Mann-Whitney U test is that the two samples are from a single population, which means that their probability distributions are equal. In the methVisual package the Mann-Whitney U test is applied in order to test if the distribution of methylated and non methylated sites in the profile under study between the given experimental sub groups of clone sequences is different. In order to calculate it, the two-tailed p-value of the Mann-Whitney U test is computed by ranking the ratios of methylated CpG sites to all CpG sites in a given clone sequence. The p-value in this case indicates if the distribution of ratio over all methylation states differ between the two groups.
曼惠特尼U检验（也称为秩，秩和检验），是一种非参数测试评估意见的两个独立样本是否来自同一分布。在以Mann-Whitney U检验的零假设是两个样本是从一个单一的人口，这意味着它们的概率分布是平等的。在methVisual包的Mann-Whitney U检验是为了测试，如果在所研究的实验克隆序列的子组之间的轮廓的甲基化和非甲基化位点的分布是不同的应用。为了计算它的Mann-Whitney U检验，双尾p-值计算居在一个给定的克隆序列的所有CpG位点甲基化的CpG位点的比率。在这种情况下的P-值表示，如果所有的甲基化状态的比例分布，两组之间的差异。


值----------Value----------

Returns a p-value
返回p值


作者（S）----------Author(s)----------


Arie Zackay <arie.zackay@mail.huji.ac.il>, Christine Steinhoff <steinhof@molgen.mpg.de>



举例----------Examples----------


## using methData[＃methData]
data(methData)
methWhitneyUTest(methData,c(1,2,3),c(4,5,6))

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