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R语言 methVisual包 MethLollipops()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 00:44:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
MethLollipops(methVisual)
MethLollipops()所属R语言包:methVisual

                                        "Lollipops" Methylation plot
                                         “棒棒糖”甲基化图

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Visualization of methylation patterns in terms of "Lollipops" plot
甲基化模式的可视化的“棒棒糖”的图


用法----------Usage----------


MethLollipops(methData)



参数----------Arguments----------

参数:methData
List; contains information on the pairwise alignments, and methylated CpG motifs.
名单包含成对的路线,和甲基化的CpG基序的信息。


Details

详情----------Details----------

The lollipops plot allows the user to study the genomic localization and states of CpG sites. Each circle marks a CpG site under study. Full circles display methylated CpGs and the non filled ones stand for non methylated CpG states. The examined sequences are aligned with respect to the genomic sequence in order to allow for an intuitive visualization of methylation states according to their genomic position.
棒棒糖图允许用户研究基因的定位和CpG位点的状态。每个圆圈,标志着下CpG位点的研究。完整的圆,显示甲基化的CPGs和非填充的非甲基化的CpG州站。检查序列的基因组序列对齐,以便直观的可视化甲基化状态,根据其基因组的位置。


值----------Value----------

Returns a "lollipop" plot
返回一个“棒棒糖”的图


作者(S)----------Author(s)----------


Arie Zackay <arie.zackay@mail.huji.ac.il>, Christine Steinhoff <steinhof@molgen.mpg.de>



举例----------Examples----------


data("methData")
MethLollipops(methData)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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