找回密码
 注册
查看: 563|回复: 0

R语言 methVisual包 MethDataInput()函数中文帮助文档(中英文对照)

[复制链接]
发表于 2012-2-26 00:44:16 | 显示全部楼层 |阅读模式
MethDataInput(methVisual)
MethDataInput()所属R语言包:methVisual

                                        Sequences match control
                                         序列匹配控制

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Control function in order to check existence of sequences .faste files
控制功能快速以太网的文件,以检查序列存在。


用法----------Usage----------


MethDataInput(sFileName)



参数----------Arguments----------

参数:sFileName
String; path and name of the Tab delimited text file which includes the names and paths of sequences under study
制表符分隔的文本文件,其中包括正在研究序列的名称和路径字符串;路径和名称


Details

详情----------Details----------

This procedure controls whether the *.fasta files written in a tabdelimited file are exact match es to the *.fasta in given paths. It is useful if the tab delimited text file was created by hand. This can prevent non existing clone sequence files stopping the workflow in the later analysis steps. The input is a character string which is the path and name of the tab delimited text file which includes the names and paths of sequences under study. It returns a data frame object with names and paths of existing clone sequences.
此过程控制的*。的FASTA在tabdelimited文件编写的文件是否是完全匹配的ES *在给定的路径。FASTA。制表符分隔的文本文件,它是有用的,如果是手工创建。这可以防止非现有的克隆序列文件停止工作流程,在以后的分析步骤。输入是一个字符串,它是制表符分隔的文本文件,其中包括正在研究序列的名称和路径的路径和名称。它与现有的克隆序列的名称和路径返回一个数据框的对象。


值----------Value----------

Returns a data frame object with names and paths of existing analysed sequences
返回一个数据框的对象,与现有的分析序列的名称和路径


作者(S)----------Author(s)----------


Arie Zackay <arie.zackay@mail.huji.ac.il>, Christine Steinhoff <steinhof@molgen.mpg.de>



举例----------Examples----------


## This pipeline will save the package example data  [#这条管线将保存包数据为例]
## in tests directory under your R.home() directory [#在测试目录下你的R.home(目录)]
## make sure that you have writing [#确保您已经编写]
## permission under R.home() directory. If you do not have permission[#许可根据R.home(目录)。如果你没有权限]
## choose your own path.[#选择自己的道路。]

dir.create(file.path(R.home(component="home"),"/BiqAnalyzer"))
makeLocalExpDir(dataPath="/examples/BiqAnalyzer",
        localDir=file.path(R.home(component="home"),"/BiqAnalyzer"))
datameth <-MethDataInput(file.path(R.home(component="home"),
                                "/BiqAnalyzer/PathFileTab.txt"))

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

手机版|小黑屋|生物统计家园 网站价格

GMT+8, 2025-2-3 16:10 , Processed in 0.024611 second(s), 15 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2024 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表