R语言 metahdep包 HGU.newnames()函数中文帮助文档(中英文对照)

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HGU.newnames(metahdep)
HGU.newnames()所属R语言包：metahdep

                                        HGU.newnames
                                         HGU.newnames

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

An illustrative example of a data.frame with 3 columns.   The first column is named "chip", the second "old.name", and the third "new.name".   The rows each hold the name of a chip type, a chip-specific probeset name, and a common name used to match probesets across different chip versions.
data.frame与3列的一个例证。第一列被命名为“芯片”，第二届“old.name”，第三“new.name”。每一行持有的芯片类型，一个芯片的具体probeset名称，和一个共同的名字，在不同版本的芯片用于匹配probesets名称。


用法----------Usage----------


data(HGU.newnames)



格式----------Format----------

A data.frame with observations on the following 3 variables for a subset of probesets on different chip types.
一个data.frame在以下3个不同的芯片类型probesets的一个子集的变量的观测。




chip a character vector specifying the chip type
chip字符向量指定芯片类型




old.name a character vector specifying the probeset name on the chip type
old.name字符指定芯片类型probeset名称，向量




new.name a character vector specifying the common identifier, such as an Entrez Gene ID, for the probeset on the chip type
new.name指定一个字符向量Entrez基因身份证，如常见的标识，芯片类型probeset


Details

详情----------Details----------

This is an example of a newnames argument that is required by the metahdep.format function.   When paired with a list of ES.obj class objects (see HGU.DifExp.list) this allows the metahdep.format()  function to assemble all of the information from all of the studies for a specific gene.   The new.name is a 'common' identifier, e.g., an Entrez Gene ID.  Different studies may use different chip types, or different versions of chips, where information for a gene with a particular Entrez Gene ID may have a different probeset name on each chip type.   This newnames argument is meant to facilitate the matching of gene information across different chip types. See the metahdep package vignette for more details on the construction of this object.
这是一个newnamesmetahdep.format函数需要的参数的一个例子。当配对的列表ES.obj类的对象（见HGU.DifExp.list），这使得metahdep.format()功能组装的所有信息从一个特定的基因研究。 new.name是一个“共同”的标识，例如，Entrez基因身份证。不同的研究，可能会使用不同的芯片类型，或不同版本的芯片，一个基因与一个特定的Entrez基因ID的信息，每个芯片的类型可能有不同的probeset名称。这newnames论点是，以方便在不同的芯片类型的基因信息相匹配。为建设这个对象的更多细节，请参阅metahdep包小插曲。


参考文献----------References----------

Bioinformatics, 25(19):2619-2620.


举例----------Examples----------


data(HGU.newnames)
head(HGU.newnames)

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