MEDIPS.plotCoverage(MEDIPS)
MEDIPS.plotCoverage()所属R语言包:MEDIPS
Function plots the results of the MEDIPS.coverageAnalysis function.
功能图的MEDIPS.coverageAnalysis功能的的结果。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The results of the coverage analysis will be visualized by the function.
覆盖分析的结果,将可视化的功能。
用法----------Usage----------
MEDIPS.plotCoverage(coverageObj = NULL)
参数----------Arguments----------
参数:coverageObj
The coverage results object returned by the MEDIPS.coverageAnalysis function
覆盖效果对象的MEDIPS.coverageAnalysis功能返回
值----------Value----------
The coverage plot will be visualized.
将可视化的覆盖面图。
作者(S)----------Author(s)----------
Lukas Chavez
举例----------Examples----------
library(BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19)
file=system.file("extdata", "MeDIP_hESCs_chr22.txt", package="MEDIPS")
CONTROL.SET = MEDIPS.readAlignedSequences(BSgenome="BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19", file=file)
CONTROL.SET = MEDIPS.getPositions(data = CONTROL.SET, pattern = "CG")
cr.control = MEDIPS.coverageAnalysis(data = CONTROL.SET, extend = 400, no_iterations = 10)
MEDIPS.plotCoverage(cr.control)
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注:
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