MEDIPS.mergeFrames(MEDIPS)
MEDIPS.mergeFrames()所属R语言包:MEDIPS
Merges genomic coordinates of overlapping frames into one supersized frame
合并成一个超大帧重叠帧的基因组坐标
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
In case, the MEDIPS.diffMethyl function was excecuted by setting the value of the step parameter < the value of frame_size the parameter, one may end up with overlapping significant frames. For these cases it is worthwhile to merge overlapping regions into one supersized frame.
的情况下,MEDIPS.diffMethyl功能excecuted设置的步骤参数的值<参数frame_size的价值,最终可能显著帧重叠。对于这些情况,这是值得合并成一个超大帧重叠的区域。
用法----------Usage----------
MEDIPS.mergeFrames(frames = NULL)
参数----------Arguments----------
参数:frames
is a matrix received by the MEDIPS.selectSignificants() function.
是由MEDIPS.selectSignificants()函数收到一个矩阵。
值----------Value----------
The remaining distinct frames are represented only by their genomic coordinates within the returned results table
其余的不同的帧仅代表其基因组的坐标,在返回的结果表
参数:chromosome
the chromosome of the merged frame
合并帧的染色体
参数:start
the start position of the merged frame
合并帧的起始位置
参数:stop
the stop position of the merged frame
合并帧的停止位置
The results table does not contain any merged rpm, rms, variance, p.value, etc. values.
结果表中不包含任何合并的转速,均方根值,方差,p.value等价值。
作者(S)----------Author(s)----------
Lukas Chavez
举例----------Examples----------
regions=as.data.frame(list(chr=c("chr22", "chr22"), start=c(1000, 1250), stop=c(1500,1750)))
regions.merged=MEDIPS.mergeFrames(regions)
regions.merged
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注:
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