R语言 mdqc包 plot.mdqc()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plot.mdqc(mdqc)
plot.mdqc()所属R语言包：mdqc

                                        The plot method for a MDQC object
                                         MDQC对象的图法

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The plot method for a MDQC object, which plots ...
图MDQC对象的方法，该图...


用法----------Usage----------


## S3 method for class 'mdqc'
plot(x, levels = c(0.9, 0.95, 0.99), xlab="", ylab="",
mfrow=NULL, mfcol=NULL, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
An object of the class "mdqc".
一个类的mdqc的对象。


参数：levels
A vector or scalar between 0 and 1 for displaying critical values for outliers. See details.
0和1之间的一个向量或标量显示为离群值的临界值。查看详情。


参数：xlab
The label for for x-axis. Note that when there are multiple plots, the same value of this argument is used for each one.
为x轴的标签。需要注意的是，当有多个图，为每一个使用此参数值相同。


参数：ylab
The label for the y-axis. Note that when there are multiple plots, the same value of this argument is used for each one.
y轴的标签。需要注意的是，当有多个图，为每一个使用此参数值相同。


参数：mfrow
Specify the arrangement of plots on the page, by rows, or leave NULL to let the function work it out
在页面上指定的图安排，按行，或离开NULL让功能工作


参数：mfcol
As for mcol, but arrange plots by column instead
至于MCOL，但安排图列，而不是


参数：...
Other arguments passed to the default plot method.
其他参数传递给方法的默认图。


Details

详情----------Details----------

This plot method is for the output from the function mdqc, and plots the Mahalanobis distances for each array. The levels argument plots horizontal lines at critical values (based on the quantiles of a chi-squard distribution), and aids in identifying outliers.
此图的方法是从输出功能mdqc，图为每个阵列的马氏距离。 levels参数图在临界值的水平线（上根据卡squard分布的分位数），并确定离群艾滋病。

For further details, see <CITE>Cohen Freue et al. (2007)</CITE>
欲知详情，请参阅<CITE>科恩Freue等。 （2007）</引用>


作者（S）----------Author(s)----------


Justin Harrington <a href="mailto:harringt@stat.ubc.ca">harringt@stat.ubc.ca</a> and Gabriela
V. Cohen Freue <a href="mailto:gcohen@stat.ubc.ca">gcohen@stat.ubc.ca</a>.



参考文献----------References----------

R. and Scherer, A. and McManus, B. and Keown, P. and McMaster, W. R. and Ng, R. T. (2007) &lsquo;MDQC: A New Quality Assessment Method for Microarrays Based on Quality Control Reports&rsquo;. Bioinformatics 23, 3162 &ndash; 3169.

参见----------See Also----------

mdqc
mdqc


举例----------Examples----------


data(allQC)
mdout <- mdqc(allQC, method="cluster", k=3)
plot(mdout)

## Just one critical value[＃只有一个临界值]
plot(mdout, levels=0.9)

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