calcMW(MassArray)
calcMW()所属R语言包:MassArray
Calculate molecular weight
计算分子量
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Function to calculate molecular weight of a fragment generated by the MassCLEAVE assay for either the T or C cleavage reactions
函数来计算的T或C裂解反应产生由MassCLEAVE检测片段的分子量
用法----------Usage----------
calcMW(sequence, extra = c("5OH", "5PPP-3P", "5PPP-3OH"), adduct = c("", "Na", "K"), rxn = c("T", "C"))
参数----------Arguments----------
参数:sequence
Nucleotide sequence input
核苷酸序列输入
参数:extra
One of "5OH" (default), "5PPP-3P", or "5PPP-3OH" describing 5' and/or 3' modifications of the fragment
“5OH”(默认),的“5PPP-3P”,或“5PPP-的3OH”描述5“和/或修改的片段3
参数:adduct
One of 'Na', 'K', or ” (default) specifying whether or not the molecular weight should be calculated for a salt adduct
“娜”,“K”或“(默认)指定是否应计算盐的加合物或分子量
参数:rxn
One of 'T' or 'C' indicating which cleavage reaction is employed to generate the fragment
一个“T”或“C”表示采用裂解反应产生的碎片
值----------Value----------
Returns a numerical output corresponding to the molecular weight (in Da) of sequence input. Note that the output may actually represent multiple molecular weights if/whenever the input sequence contains one or more degenerate bases (e.g. R or Y).
返回一个数字输出相应的序列输入(大)的分子量。请注意,输出实际上可能代表多个分子量,如果/时输入序列中包含一个或多个退化碱基(如R或Y)。
作者(S)----------Author(s)----------
Reid F. Thompson (<a href="mailto:rthompso@aecom.yu.edu">rthompso@aecom.yu.edu</a>), John M. Greally (<a href="mailto:jgreally@aecom.yu.edu">jgreally@aecom.yu.edu</a>)
举例----------Examples----------
calcMW("AAATCCC")
calcMW("AARTYCC")
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注:
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