R语言 marray包 stat.confband.text()函数中文帮助文档(中英文对照)

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stat.confband.text(marray)
stat.confband.text()所属R语言包：marray

                                        Rank genes according to the value of a statistic.
                                         排名是根据一个统计值的基因。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Select values based on intensities binning.
选择强度分级为基础的价值观。


用法----------Usage----------


stat.confband.text(M, A, crit1=0.025, crit2=crit1, nclass=5)



参数----------Arguments----------

参数：A
a vector giving the x-coordinates of the points in the scatter plot. In the microarray context, this could be a vector of average log intensities. ie A  
向量的散点图中的点x坐标。在芯片方面，这可能是一个平均log强度的向量。即A


参数：M
a vector giving the y-coordinates of the points in the scatter plot. In the microarray context, this could be a vector of log intensity ratios.  
散点图中的点的y坐标向量。在芯片方面，这可能是一个向量log强度的比值。


参数：crit1
The number of points to be selected. If crit1 < 1, the crit1*100% spots with the smallest M values will be selected. If crit1 >= 1, the crit spots  with the smallest M values are selected.   
被选中的点数。如果CRIT1 <1的CRIT1 * 100％，最小的M值点会被选中。如果CRIT1> = 1，M值与最小的爆击点选择。


参数：crit2
Similar to "crit1".   If crit2 < 1, the crit2*100% spots with the largest M values will be selected. If crit2 >= 1, the crit2 spots with the largest M values are selected.   
类似“CRIT1”。如果crit2 <1的crit2 * 100％，M值最大的点会被选中。如果crit2> = 1，M值最大的crit2点选择。


参数：nclass
A single number giving the approximate number of intensity depedent groups to consider.  
强度应变数组的近似数，考虑一个单一的数字。


值----------Value----------

A vector of selected spot index.
选定现货指数的向量。


参见----------See Also----------

stat.gnames
stat.gnames


举例----------Examples----------


library(marray)
data(swirl)
aveA <- apply(maA(swirl), 1, mean.na)
aveM <- apply(maM(swirl), 1, mean.na)
stat.confband.text(aveM, aveA, crit1=20, crit2=50, nclass=5)

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