maNormMed(marray)
maNormMed()所属R语言包:marray
Median location normalization function
中位数的位置标准化功能
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function is used for location normalization using the median of intensity log-ratios for a group of spots. The function should be used as an argument to the main normalization function maNormMain.
此功能是用于log比率为一组的斑点位置,使用强度的中位数标准化。应作为主要标准化功能maNormMain参数的功能。
用法----------Usage----------
maNormMed(x=NULL, y="maM", subset=TRUE)
参数----------Arguments----------
参数:x
Name of accessor method for spot statistic used to stratify the data, usually a layout parameter, e.g. maPrintTip or maPlate. If x is not a character, e.g. NULL, the data are not stratified.
存取点统计方法采用分层的数据,通常是一个布局参数的名称,如maPrintTip或maPlate。 x如果是不是一个字符,例如NULL,该数据是不分层。
参数:y
Name of accessor method for spot statistics, usually maM.
现货统计存取方法的名称,通常是maM。
参数:subset
A "logical" or "numeric" vector indicating the subset of points used to compute the location normalization values.
“逻辑”或“数字”向量表示用来计算的位置标准化值的点的子集。
值----------Value----------
A function with bindings for the above arguments. This latter function takes as argument an object of class "marrayRaw" (or possibly "marrayNorm"), and returns a vector of fitted values to be subtracted from the raw log-ratios. It calls the function maMed, which is not specific to microarray objects.
上述论点的一个绑定功能。后者的功能需要一个类的对象作为参数"marrayRaw"(或可能"marrayNorm"),并返回一个从原始log比率减去拟合值的向量。它调用功能maMed,这是不特定的微阵列对象。
作者(S)----------Author(s)----------
Sandrine Dudoit, <a href="http://www.stat.berkeley.edu/~sandrine">http://www.stat.berkeley.edu/~sandrine</a>.
参考文献----------References----------
exploratory analysis and normalization of cDNA microarray data. In G. Parmigiani, E. S. Garrett, R. A. Irizarry and S. L. Zeger, editors, The Analysis of Gene Expression Data: Methods and Software, Springer, New York.<br> <br>
microarray data. In M. L. Bittner, Y. Chen, A. N. Dorsel, and E. R. Dougherty (eds), Microarrays: Optical Technologies and Informatics, Vol. 4266 of Proceedings of SPIE.<br> <br>
(2002). Normalization for cDNA microarray data: a robust composite method addressing single and multiple slide systematic variation. Nucleic Acids Research, Vol. 30, No. 4.
参见----------See Also----------
maNormMain, maMed, median.
maNormMain,maMed,median。
举例----------Examples----------
# See examples for maNormMain.[请参阅maNormMain例子。]
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