maNorm2D(marray)
maNorm2D()所属R语言包:marray
2D spatial location normalization function
二维空间位置标准化功能
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function is used for 2D spatial location normalization, using the robust local regression function loess. It should be used as an argument to the main normalization function maNormMain.
此功能是用于二维空间位置标准化,使用强大的本地回归函数loess。它应该被用来作为一个主要的标准化功能maNormMain的参数。
用法----------Usage----------
maNorm2D(x="maSpotRow", y="maSpotCol", z="maM", g="maPrintTip", w=NULL,
subset=TRUE, span=0.4, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
Name of accessor method for spot row coordinates, usually maSpotRow.
现货行存取方法的名称坐标,通常是maSpotRow。
参数:y
Name of accessor method for spot column coordinates, usually maSpotCol.
存取方法的名称,点列坐标,通常是maSpotCol。
参数:z
Name of accessor method for spot statistics, usually the log-ratio maM.
现货统计的存取方法,通常数比maM的名称。
参数:g
Name of accessor method for print-tip-group indices, usually maPrintTip.
打印头组指数的存取方法的名称,通常是maPrintTip。
参数:w
An optional numeric vector of weights.
一个可选的数字向量的重量。
参数:subset
A "logical" or "numeric" vector indicating the subset of points used to compute the fits.
“逻辑”或“数字”表示用来计算适合的点的子集的向量。
参数:span
The argument span which controls the degree of smoothing in the loess function.
参数span控制loess函数的平滑度。
参数:...
Misc arguments
其他参数
Details
详情----------Details----------
The spot statistic named in z is regressed on spot row and column coordinates, separately within print-tip-group, using the loess function.
z命名当场统计回归现货行和列坐标,分别在打印头组,使用loess功能。
值----------Value----------
A function with bindings for the above arguments. This latter function takes as argument an object of class "marrayRaw" (or possibly "marrayNorm"), and returns a vector of fitted values to be substracted from the raw log-ratios. It calls the function ma2D, which is not specific to microarray objects.
上述论点的一个绑定功能。后者的功能需要一个类的对象作为参数"marrayRaw"(或可能"marrayNorm"),并返回一个向量从原始log比率中减去拟合值。它调用功能ma2D,这是不特定的微阵列对象。
作者(S)----------Author(s)----------
Sandrine Dudoit, <a href="http://www.stat.berkeley.edu/~sandrine">http://www.stat.berkeley.edu/~sandrine</a>.
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
maNormMain, ma2D, loess.
maNormMain,ma2D,loess。
举例----------Examples----------
# See examples for maNormMain.[请参阅maNormMain例子。]
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