htmlPage(marray)
htmlPage()所属R语言包:marray
Display gene list as a HTML page
作为一个HTML页面显示基因列表
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Given a set of index to a data.frame containing gene names information. We create a web page with one element per genes that contains URLs links to various external database links. E.g Operon oligodatabase , Riken, GenBank and PubMed web sites.
给出了一套指标,以数据框包含基因地名信息。我们创建一个网页,每一个基因的元素,它包含的网址链接到各种外部数据库连接。如正负oligodatabase,理研,GenBank和医学网站。
用法----------Usage----------
htmlPage(genelist, filename = "GeneList.html", geneNames =
Gnames, mapURL = SFGL, othernames, title, table.head,
table.center = TRUE, disp = c("browser", "file")[1])
table2html(restable, filename = "GeneList.html", mapURL = SFGL,
title, table.head, table.center = TRUE, disp =
c("browser", "file")[1])
参数----------Arguments----------
参数:restable
A data.frame that contains only the information you wish to display in the html file. The rows corresponds to a different DNA spots.
数据框只包含你想在HTML文件中显示的信息。行对应一个不同的DNA点。
参数:genelist
A numeric vector of index to a data.frame
一个索引数字矢量数据框
参数:filename
The name of the file to store the HTML in.
该文件的名称存储在HTML英寸
参数:geneNames
A data.frame containing the information related the each DNA spots.
数据框包含的信息有关的每一个DNA点。
参数:mapURL
A matrix of characters containing the URL for various external database. E.g SFGL.
一个含有各种外部数据库的URL的字符矩阵。 E.gSFGL。
参数:othernames
A data.frame containing other information.
数据框包含其他信息。
参数:title
Title of the HTML page
HTML页面标题
参数:table.head
A character vector of column labels for the table
为表列标签的特征向量
参数:table.center
A logical indicating whether the table should be centered
一个逻辑指示表是否应集中
参数:disp
Either "File" or "Browser" (default is Browser). File will save the information in html file, while Browser will create an html files and display information in the user's browser.
“文件”或“浏览器”(默认为浏览器)。文件将保存在HTML文件中的信息,同时浏览器会创建一个HTML文件,并显示在用户的浏览器中的信息。
Details
详情----------Details----------
This function is an extension to ll.htmlpage
此功能是扩展ll.htmlpage
值----------Value----------
No value is return, the function produce a html file "filename" and output the results in a browser.
没有价值的回报,该函数产生一个HTML文件“文件名”,并在浏览器中的输出结果。
作者(S)----------Author(s)----------
Yee Hwa Yang
参见----------See Also----------
ll.htmlpage, URLstring, widget.mapGeneInfo
ll.htmlpage,URLstring,widget.mapGeneInfo
举例----------Examples----------
##library(annotate)[#库(注释)]
data(swirl)
Gnames <- maGeneTable(swirl)
swirlmap <- mapGeneInfo(Name = "none", ID="genbank")
## htmlPage(100:110, geneNames = Gnames, mapURL = swirlmap, title="Swirl")[#htmlPage(100:110,geneNames = Gnames,mapURL = swirlmap,标题=“旋流”)]
moreinfo <- round(maM(swirl), 2)
swirlmap <- mapGeneInfo(Name = "pubmed", ID="genbank")
##htmlPage(100:110, geneNames = Gnames, mapURL = swirlmap, othernames=moreinfo, title="Swirl", disp="file")[#htmlPage(100:110,geneNames = Gnames,mapURL = swirlmap,othernames = moreinfo,标题=“漩涡”,DISP =“文件”)]
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