R语言 MANOR包 qscores()函数中文帮助文档(中英文对照)

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qscores(MANOR)
qscores()所属R语言包：MANOR

                                        Examples of qscore objects (quality scores) to apply to CGH arrays
                                         qscore对象的例子（质量分数），适用于CGH芯片

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This data set provides qscore objects that can be applied to normalized arrayCGH objects in order to evaluate data quality after normalization.
该数据集提供了qscore可应用于标准化后，以评估数据质量归arrayCGH对象的对象。


用法----------Usage----------


data(qscores)



格式----------Format----------

The following qscore objects are provided:
提供以下qscore对象是：

clone.qscore
clone.qscore

pct.clone.qscore
pct.clone.qscore

pct.spot.qscore
pct.spot.qscore

pct.spot.before.qscore
pct.spot.before.qscore

pct.replicate.qscore
pct.replicate.qscore

smoothness.qscore
smoothness.qscore

var.replicate.qscore
var.replicate.qscore

dyn.x.qscore
dyn.x.qscore

dyn.y.qscore
dyn.y.qscore


注意----------Note----------

People interested in tools for array-CGH analysis can
阵列比较基因组杂交分析工具有兴趣的人可以


作者（S）----------Author(s)----------


Pierre Neuvial, <a href="mailto:manor@curie.fr">manor@curie.fr</a>.



源----------Source----------

Institut Curie, manor@curie.fr.
居里研究所，manor@curie.fr。


参见----------See Also----------

spatial, qscore.summary.arrayCGH,
spatial，qscore.summary.arrayCGH


举例----------Examples----------


data(qscores)
data(spatial)

## define a list of qscores[＃定义qscores列表。]
qscore.list <- list(clone=clone.qscore, pct.clone=pct.clone.qscore,
pct.spot=pct.spot.qscore, pct.replicate=pct.replicate.qscore,
smoothness=smoothness.qscore, dyn.x=dyn.x.qscore, dyn.y=dyn.y.qscore,
var.replicate=var.replicate.qscore)

## compute quality scores for a couple of normalized arrays[＃计算质量分数为情侣归阵列]
gradient.norm$quality <- qscore.summary.arrayCGH(gradient.norm,
qscore.list)
print(gradient.norm$quality[, 2:3])

qscore.list$dyn.x$args$test <- 23
qscore.list$dyn.y$args$test <- 24
edge.norm$quality <- qscore.summary.arrayCGH(edge.norm, qscore.list)
print(edge.norm$quality[, 2:3])

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