nem(MANOR)
nem()所属R语言包:MANOR
Spatial Classification by EM algorithm
由EM的空间分类算法
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The function nem computes spatial classification by EM algorithm.
的功能nem计算EM算法的空间分类。
用法----------Usage----------
## Default S3 method:[默认方法]
nem(LogRatio, Col, Row, nk=nk, beta=1, iters=2000, ...)
## S3 method for class 'arrayCGH'
nem(arrayCGH, variable, nk=5, beta=1, iters=2000, ...)
参数----------Arguments----------
参数:LogRatio
Vector that corresponds to the values to be classified.
向量对应的值来进行分类。
参数:Col
Vector of columns coordinates.
列向量坐标。
参数:Row
Vector of rows coordinates.
行向量的坐标。
参数:nk
Integer value corresponding to the number classes.
Integer值,相应的数量类。
参数:beta
Scale parameter for importance of spatial information.
尺度参数空间信息的重要性。
参数:iters
Maximum number of iterations allowed.
迭代允许的最大数量。
参数:arrayCGH
Object of class arrayCGH.
对象类arrayCGH。
参数:variable
Variable that corresponds to the values to be classified.
变量对应的值来进行分类。
参数:...
...
...
值----------Value----------
Either a data frame with the following added elements:
无论是与下面的添加元素的数据框:
参数:ZoneNem
Vector of label zones.
矢量标签区。
or an object of class arrayCGH with the following elements added to the data.frame attribute arrayValues:
或一个类的对象arrayCGH以下内容添加到数据框属性arrayValues:
参数:ZoneNem
Vector of label zones.
矢量标签区。
注意----------Note----------
People interested in tools for array-CGH analysis can
阵列比较基因组杂交分析工具有兴趣的人可以
作者(S)----------Author(s)----------
Philippe Hup |