R语言 maigesPack包 normLoc()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

normLoc(maigesPack)
normLoc()所属R语言包：maigesPack

                                         Normalise a cDNA Microarray Object
                                         Normalise cDNA微阵列对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function loads a maigesRaw object and corrects for location bias.
这个函数加载maigesRaw对象和位置偏差的纠正。


用法----------Usage----------


normLoc(obj=NULL, ...)



参数----------Arguments----------

参数：obj
object of type maigesRaw to be normalised.
对象的类型maigesRaw被归。


参数：...
additional parameters for function normalizeWithinArrays from limma package.
功能normalizeWithinArrayslimma包的额外的参数。


Details

详情----------Details----------

This function for normalisation is entirely based on the function normalizeWithinArrays from limma package. See their help page to known how to setup the parameters correctly. The parameters layout and weights, are automatically specified by the object obj and must not be specified.
这种标准化的功能，完全是基于功能normalizeWithinArrays从limma包。看到他们的帮助页面已知如何正确设置参数。参数layout和weights，会自动指定对象obj“不得指定。


值----------Value----------

This function returns a maiges object.
此函数返回一个maiges对象。


作者（S）----------Author(s)----------



Gustavo H. Esteves &lt;<a href="mailto:gesteves@vision.ime.usp.br">gesteves@vision.ime.usp.br</a>&gt;




参见----------See Also----------

normalizeWithinArrays from limma package.
normalizeWithinArrays的limma包。


举例----------Examples----------


## Loading the dataset[＃载入数据集]
data(gastro)

## Do the normalization by loess method and span 0.4[＃对黄土的方法和跨度0.4标准化]
gastro.norm = normLoc(gastro.raw2, span=0.4, method="loess")

## Do the same normalization without background subtraction[＃不相同的标准化背景减法]
gastro.norm = normLoc(gastro.raw2, span=0.4, method="loess", bc.method="none")

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