maigesDEcluster-class(maigesPack)
maigesDEcluster-class()所属R语言包:maigesPack
maigesDEcluster class, store results of differential gene expression analysis
maigesDEcluster类,基因差异表达分析结果存储
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This class extends the class maigesDE to store results from differential expression analysis. It is produced in the same way as the latter, but has one more slot containing the W values. This is useful to do cluster analysis. Together the slots of the maigesDE class, it has one more given in Slots section.
这个类扩展了类maigesDE存储的差异表达分析的结果。它产生的,因为后者同样的方式,但有一个插槽包含W值。做聚类分析,这是非常有用的。一起maigesDE类的插槽,它有一个槽部分给出。
Details
详情----------Details----------
Objects of this class are produced in the same way as maigesDE. The addition of the slot W turn possible to do cluster analysis in this class of objects using the functions hierMde, somMde and kmeansMde, selecting genes according to the results of gene expression analysis.
这个类的对象是在同样的方式为maigesDE。插槽除了W转做聚类分析,在这一类使用功能的对象hierMde,somMde和kmeansMde,选择基因,根据基因的结果表达分析。
插槽----------Slots----------
W: numeric matrix containing the W values for the
W:数字矩阵为W值
方法----------Methods----------
boxplot signature(x = 'maigesDEcluster'): boxplot method for maigesDEcluster class. Display boxplots of one gene
盒形图signature(x = 'maigesDEcluster'):盒形图的方法maigesDEcluster类。显示一个基因盒状图
plot signature(x = 'maigesDEcluster'): plot method for
图signature(x = 'maigesDEcluster'):积方法
print signature(x = 'maigesDEcluster'): print method for
打印signature(x = 'maigesDEcluster'):打印方法
show signature(x = 'maigesDEcluster'): show method for
显示signature(x = 'maigesDEcluster'):show方法
summary signature(x = 'maigesDEcluster'): summary method for
摘要signature(x = 'maigesDEcluster'):简易方法
作者(S)----------Author(s)----------
Gustavo H. Esteves <<a href="mailto:gesteves@vision.ime.usp.br">gesteves@vision.ime.usp.br</a>>
参见----------See Also----------
deGenes2by2Ttest, deGenes2by2Wilcox, deGenes2by2BootT, deGenesANOVA, hierMde, somMde, kmeansMde.
deGenes2by2Ttest,deGenes2by2Wilcox,deGenes2by2BootT,deGenesANOVA,hierMde,somMde,kmeansMde。
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