R语言 maigesPack包 maigesDE-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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maigesDE-class(maigesPack)
maigesDE-class()所属R语言包：maigesPack

                                         maigesDE class, store results of differential gene expression analysis
                                         maigesDE类，基因差异表达分析结果存储

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This class defines a structure to store the results from differential expression analysis. This type of analysis can be done using the functions deGenes2by2Ttest, deGenes2by2Wilcox and deGenes2by2BootT for analysis between two biological sample types, or function deGenesANOVA, for analysis between more than two sample types using ANOVA models.
这个类定义了一个结构来存储从差异表达分析结果。使用功能，这种类型的分析可以做deGenes2by2Ttest，deGenes2by2Wilcox和deGenes2by2BootT之间的两个生物样品类型，或功能deGenesANOVA两个以上的样本，分析之间的分析使用方差分析模型的类型。


Details

详情----------Details----------

Objects of this class are produced by calling the functions deGenes2by2Ttest, deGenes2by2Wilcox and deGenes2by2BootT over an object of class maiges or by calling the function deGenesANOVA over an object of class maigesANOVA fitting an ANOVA model to the microarray dataset.
这个类的对象是由deGenes2by2Ttest，deGenes2by2Wilcox和deGenes2by2BootT一个类对象maiges或通过调用函数deGenesANOVA超过一个对象调用的功能类maigesANOVA拟合方差分析模型的芯片集。


插槽----------Slots----------




GeneInfo: data frame containing the information
GeneInfo：数据框包含的信息




SampleInfo: data frame similar to the GeneInfo above, but containing information about the biological sample
SampleInfo：类似GeneInfo以上的数据框，但有关生物样品中含有的信息




fold: numerical matrix containing the fold values (mean difference between the sample types) when two sample types
fold：数值矩阵包含倍值（平均样本类型之间的差异）时，两个样品类型




stat: numerical matrix giving the statistic of the
stat：数值矩阵的统计




p.value: numerical matrix giving the p-values of the
p.value：数值矩阵的P-值




factors: character string giving the biological factors
factors：字符串，生物因素




test: character string describing the test done.
test：字符串描述完成测试。




Date: character string giving date and time that the
Date：字符串，日期和时间




V.info: list containg three characters. The first one is a string containing the R version used when the object was created. The second is a char vector with base packages and the last one is another char vector with additional packages and
V.info：列表containg三个大字。第一个是一个字符串，其中包含创建对象时使用的R版本。第二个是基础包炭向量和最后一个字符向量和另一个额外的软件包


方法----------Methods----------




plot signature(x = 'maigesDE'): plot method for
图signature(x = 'maigesDE')：积方法




print signature(x = 'maigesDE'): print method for
打印signature(x = 'maigesDE')：打印方法




show signature(x = 'maigesDE'): show method for
显示signature(x = 'maigesDE')：show方法




summary signature(x = 'maigesDE'): summary method for
摘要signature(x = 'maigesDE')：简易方法


作者（S）----------Author(s)----------



Gustavo H. Esteves &lt;<a href="mailto:gesteves@vision.ime.usp.br">gesteves@vision.ime.usp.br</a>&gt;




参见----------See Also----------

deGenes2by2Ttest, deGenes2by2Wilcox, deGenes2by2BootT, deGenesANOVA.
deGenes2by2Ttest，deGenes2by2Wilcox，deGenes2by2BootT，deGenesANOVA。

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