contrastsFitM(maigesPack)
contrastsFitM()所属R语言包:maigesPack
Compute Contrasts from Linear Model Fit
从线性模型拟合计算对比
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Given a linear model fit to microarray data, compute estimated coefficients and standard errors for a given set of contrasts. This function was adapted from contrasts.fit of the limma package.
由于微阵列数据的线性模型拟合,计算估计系数和标准误差为给定的一组对比。此功能被改编从contrasts.fit的limma包。
用法----------Usage----------
contrastsFitM(fit, contrasts)
参数----------Arguments----------
参数:fit
an MArrayLM object or a list object produced by the function lm.series or equivalent.
MArrayLM对象或功能lm.series或同等学历产生一个列表对象。
参数:contrasts
numeric matrix with row corresponding to coefficients in fit and columns containing contrasts. May be a vector if there is only one contrast.
适合列包含对比系数相应行的数字矩阵。可能是一个向量,如果只有一个对比。
Details
详情----------Details----------
This function was adapted from the equivalent contrasts.fit limma's function to do the linear model fit without use the empirical Bayes method given by the function eBayes.
此功能被改编相当于的contrasts.fitlimma的功能没有使用功能eBayes经验Bayes方法的线性模型的拟合。
值----------Value----------
The result of this function is an object of class MArrayLM.
这个函数的结果是一个对象类MArrayLM。
作者(S)----------Author(s)----------
Gustavo H. Esteves <<a href="mailto:gesteves@vision.ime.usp.br">gesteves@vision.ime.usp.br</a>>, adapted from
the limma's function.
参见----------See Also----------
lmFit, contrasts.fit, eBayes, MArrayLM.
lmFit,contrasts.fit,eBayes,MArrayLM。
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注:
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