R语言 maigesPack包 bootstrapMI()函数中文帮助文档(中英文对照)

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bootstrapMI(maigesPack)
bootstrapMI()所属R语言包：maigesPack

                                         Calculate bootstrap p-values for mutual information (MI) measures
                                         p值的计算互信息（MI）的措施引导

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes a numerical matrix (or two vectors) and calculates bootstrapped (by permutation) p-values to test if the mutual information value is equal to zero. If the first argument is a matrix, the p-values are calculated between all pairs of rows of the matrix.
这个函数接受一个数值矩阵（或两个向量），并计算自举（置换）p值来测试互信息值等于零。如果第一个参数是一个矩阵，对矩阵的行之间的所有P-值计算。


用法----------Usage----------


bootstrapMI(x, y=NULL, bRep, ret="p-value")



参数----------Arguments----------

参数：x
numerical matrix or vector to be analysed. If a vector, the argument y must be informed.
数值矩阵或向量来进行分析。如果一个向量，参数y必须通知。


参数：y
numerical vector. Must be informed if x is a vector. If x is a matrix, this argument is ignored. Defaults to NULL.
数值向量。必须被告知，如果x是一个向量。如果x是一个矩阵，这个参数将被忽略。默认为空。


参数：bRep
number of permutation to be done in the test.
数排列在完成测试。


参数：ret
character string with the value to return. Must be 'p-value' (default) for the usual p-value or 'max', to return the maximum absolute correlation value obtained by the permutation.
返回的值的字符串。必须是“p值”（默认）为一般p值或“最大”，返回的最大绝对相关置换获得的价值。


Details

详情----------Details----------

The method implemented in this function is proposed by Butte and Kohane (2000). The MI value is calculated using the function MI.
在这个函数中实现该方法提出的小山和小羽（2000）。使用功能MI的MI值计算。


值----------Value----------

The result of this function is a square matrix (length equal to the number of rows of x) if x is a matrix or a numerical value if x and y are vectors. The result is the p-values or maximum MI values calculated by permutation tests.
这个函数的结果是x是一个矩阵或一个数值x和x是一个方阵（长度等于y行数）向量。结果是p值或最大MI排列测试计算值。


作者（S）----------Author(s)----------



Gustavo H. Esteves &lt;<a href="mailto:gesteves@vision.ime.usp.br">gesteves@vision.ime.usp.br</a>&gt;




参考文献----------References----------

functional genomic clustering using pairwise entropy measurements. In Pacific Symposium on Biocomputing, 5, 415-426, 2000 (http://psb.stanford.edu/psb-online/proceedings/psb00/)

参见----------See Also----------

MI
MI


举例----------Examples----------


x <- runif(50, 0, 1)
y <- rbeta(50, 1, 2)
bootstrapMI(x, y, bRep=100)

z <- matrix(rnorm(100, 0, 1), 4, 25)
bootstrapMI(z, bRep=100)

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