suppl(made4)
suppl()所属R语言包：made4
Projection of supplementary data onto axes from a between group analysis
从组分析上轴之间补充数据的投影
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Projection and class prediction of supplementary points onto axes from a between group analysis, bga.
投影类补充点预测到从轴之间的组分析，bga。
用法----------Usage----------
suppl(dudi.bga, supdata, supvec = NULL, assign=TRUE, ...)
## S3 method for class 'suppl'
plot(x, dudi.bga, axis1=1, axis2=2, supvec=sup$true.class, supvec.pred= sup$predicted, ...)
参数----------Arguments----------
参数：dudi.bga
An object returned by bga.
bga返回的对象。
参数：supdata
Test or blind dataset. Accepted formats are a matrix, data.frame, ExpressionSet or marrayRaw-class.
测试或盲目集。接受的格式是matrix，data.frame，ExpressionSet或marrayRaw-class。
参数：supvec
A factor or vector which describes the classes in the training dataset.
一个因素或向量，介绍了在训练集类。
参数：supvec.pred
A factor or vector which describes the classes which were predicted by suppl.
一个因素或向量，介绍了预测suppl类。
参数：assign
A logical indicating whether class assignment should be calculated using the method described by Culhane et al., 2002. The default value is TRUE.
一个逻辑指示是否应使用Culhane等人，2002年中所描述的方法计算类的分配。默认值是TRUE。
参数：x
An object returned by suppl.
suppl返回的对象。
参数：axis1
Integer, the column number for the x-axis. The default is 1.
整数，列数为x轴。默认值是1。
参数：axis2
Integer, the column number for the y-axis. The default is 2.
整数，列数为y轴。默认是2。
参数：...
further arguments passed to or from other methods.
通过进一步的论据或其他方法。
Details
详情----------Details----------
After performing a between group analysis on a training dataset using bga, a test dataset can be then projected onto bga axes using suppl.
执行对培训使用bga的数据集的1组之间分析后，测试数据集，然后可以投射bga轴使用suppl。
suppl returns the projected coordinates and assignment of each test case (array).
suppl返回每个测试用例（阵列）投影坐标和分配。
The test dataset must contain the same number of variables (genes) as the training dataset. The input format of both the training dataset and test dataset are verified using array2ade4. Use plot.bga to plot results from bga.
测试数据集必须包含的变量相同数量的训练集（基因）。训练集和测试集的输入格式验证使用array2ade4。使用plot.bga绘制BGA的结果。
值----------Value----------
A list containing:
一份列表，列出：
参数：suppl
An object returned by suppl
返回的对象suppl
作者（S）----------Author(s)----------
Aedin Culhane
参考文献----------References----------
<h3>See Also</h3> See Also <code>bga</code>, <code>between</code>, <code>plot.bga</code>,
举例----------Examples----------
data(khan)
#khan.bga<-bga(khan$train, khan$train.classes)[khan.bga <-BGA（汗火车，汗$ train.classes）]
if (require(ade4, quiet = TRUE)) {
khan.bga<-bga.suppl(khan$train, supdata=khan$test, classvec=khan$train.classes,
supvec=khan$test.classes)
khan.bga
plot.bga(khan.bga, genelabels=khan$annotation$Symbol)
khan.bga$suppl
plot.suppl(khan.bga$suppl, khan.bga)
plot.suppl(khan.bga$suppl, khan.bga, supvec=NULL, supvec.pred=NULL)
plot.suppl(khan.bga$suppl, khan.bga, axis1=2, axis2=3,supvec=NULL, supvec.pred=NULL)
}
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注：
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发表于 2012-2-26 00:02:50
