R语言 macat包 plot.MACATevalScoring()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plot.MACATevalScoring(macat)
plot.MACATevalScoring()所属R语言包：macat

                                        Plot function for MACATevalScoring objects.
                                         plot函数MACATevalScoring物体。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function plots scores, 0.025 and 0.975 quantiles of the permuted scores (grey lines), and sliding average score (red line) along the chromosome. Yellow dots highlight regions, in which the smoothed absolute scores exceed the permutation-derived quantile boundaries.
函数图的分数，位数置换分数（灰线）0.025和0.975，滑动沿染色体的平均得分（红线）。黄点突出的区域，在平滑的绝对分数超过置换派生的分量边界。


用法----------Usage----------


## S3 method for class 'MACATevalScoring'
plot(x, output = "x11",
              HTMLfilename = NULL, mytitle = NULL, new.device = TRUE, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
MACATevalScoring object.
MACATevalScoring对象。


参数：output
plot "x11" or create a "html" -file with further information. HTML-page will open automatically.
图“X11”，或建立一个“HTML”文件的进一步信息。 HTML页会自动打开。


参数：HTMLfilename
HTML-filename, default:Results<CHOMOSOME>_<CLASS>.html
HTML文件名，默认是：Results<CHOMOSOME>_<CLASS>.html


参数：mytitle
Title of HTML-page, default: &ldquo;Results of class <CLASS> on chromosome <CHROMOSOME>&rdquo;
HTML页面，默认的标题：“结果对染色体<CHROMOSOME>的<class>类”


参数：new.device
if FALSE: Possibility to plot several plots in one device
如果为FALSE：可以绘制在一台设备的几个图


参数：...
further arguments passed on to generic function plot
进一步的参数传递到泛型函数plot


Details

详情----------Details----------

One can create a HTML-page on-the-fly if argument output='html'.  The HTML-page provides informations about highlighted regions in the plot.  Furthermore there are click-able Entrezgene-IDs for further analysis.
可以创建一个HTML页面上的动态参数输出=“HTML”。在HTML页面提供的信息有关的图突出的区域。此外，还有可点击Entrezgene标识作进一步分析。


作者（S）----------Author(s)----------


MACAT development team



参见----------See Also----------

evalScoring, getResults
evalScoring，getResults


举例----------Examples----------


# see function 'evalScoring' for an example[功能，例如“evalScoring]

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