R语言 macat包 buildMACAT()函数中文帮助文档(中英文对照)

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buildMACAT(macat)
buildMACAT()所属R语言包：macat

                                        Create MACAT list from objects in workspace
                                         从工作区中的对象创建麦科特列表

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This is a wrapper around the preprocessedLoader function. Use it,  when you want to build a MACAT-list structure from objects already in your workspace.
这是一个包装周围preprocessedLoader功能。使用它，当你想建立从1的麦科特名单结构已经在您的工作区对象。


用法----------Usage----------


  buildMACAT(matrix, chip, labels = NULL, chromLocObj = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：matrix
expression matrix with rows=genes and columns=samples; Rownames have to match chip; Columnnames are not mandatory.
行=基因和列矩阵表达与样品; Rownames有相匹配的芯片;不是强制性Columnnames。


参数：chip
Identifier for used microarray
利用微阵列的标识符


参数：labels
Classlabels for samples, has to have length=number of columns in matrix
样品classlabels，必须有长度=矩阵列数


参数：chromLocObj
Object of class chromLocation specifying the genomic position, each probe on the array is mapped to. If not provided, it is build in the function using annotate's function buildChromLocation.
类的对象chromLocation指定的基因组的位置，每个探测器阵列上的映射到。如果不提供，它是建立在功能使用annotate的功能buildChromLocation。


Details

详情----------Details----------

This is only a convenience wrapper around the function preprocessedLoader for the case, that you want to build a MACAT-list from objects in your workspace.
这只是一个方便周围的功能包装preprocessedLoader的情况下，要建立麦科特的列表，从您的工作空间中的对象。


值----------Value----------

A MACAT-list structure. For an example and a description of the format see data stjude in package 'stjudem'.
结构一个麦科特名单。对于一个例子，说明格式的数据stjude包stjudem“。


作者（S）----------Author(s)----------


MACAT development team



参见----------See Also----------

preprocessedLoader,stjude in package 'stjudem'
preprocessedLoader，stjude包stjudem“


举例----------Examples----------


X <- matrix(rnorm(200),nrow=20,ncol=10)
rownames(X) <- c('34916_s_at','34917_at','34462_at','163_at','35219_at',
        '31641_s_at','33300_at','33301_g_at','38950_r_at','41249_at',
        '294_s_at','32004_s_at','33299_at','41243_at','33341_at','362_at',
        '1918_at','41499_at','41500_at','41282_s_at')
colnames(X) <- paste("Sample",1:10,sep="")
y <- rep(c("A","B"),c(5,5))
toy <- buildMACAT(X,"hgu95av2.db",y)
summary(toy)

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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