R语言 maanova包 arrayview()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

arrayview(maanova)
arrayview()所属R语言包：maanova

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                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function reconstructs the input data according to the Microarray grid location structure and plots the data according to the user specified color map.
这个功能重建输入数据，根据芯片网格位置结构和图，根据用户指定的彩色图数据。

By default, it will plot the log ratios for 2-dye array and raw intensity for 1-dye array. It does not work for N-dye (N>2) array at this time.
默认情况下，它会绘制2染料的阵列和1染料阵列的原始强度的log比率。它不工作，此时的N-染料（2）阵列。

Note that if user collapsed the replicates by using 'avgrep' in read.madata, and then  arrayview will not be available.
请注意，如果用户倒塌的重复使用“avgrepread.madata，，然后arrayview将无法使用。


用法----------Usage----------


arrayview(object, ratio, array, colormap, onScreen=TRUE, ...)



参数----------Arguments----------

参数：object
An object of class madata.
对象类madata。


参数：ratio
The data to be plotted. The length of it must be equal to the length of the grid locations, .e.g, madata$row and madata$col. If ratio is a vector, there will be one plot. If ratio is a matrix, there will be one plot for each column. If ratio is not provided, link[maanova]{make.ratio} will be called to calculate the ratios from the original data.
要绘制的数据。它的长度必须等于网格位置的长度，例如，madata行和madata美元山坳。如果比例是一个向量，会有一个图。如果比例是一个矩阵，每一列是一个图。如果没有提供比link[maanova]{make.ratio}将被称为计算从原始数据的比率。


参数：array
A list of arrays to be plotted. This variable is only valid when ratio is not provided. Whenever ratio is provided, all columns in ratio will be plotted.
要绘制一个数组列表。这个变量是唯一有效的，当ratio不提供。每当ratio提供所有列中的比例将绘制。


参数：colormap
User specified color map. See colors for more detail.
用户指定的彩色图。看到colors更多细节。


参数：...
Other parameters to be passed to image.
其他参数被传递到image。


参数：onScreen
A logical value to represent whether to display the plots on screen or not. If TRUE, x11() (in Unix/Windows) or macintosh (in Mac) will be called inside the function. Otherwise, it will plot the figure on the current device. Default is TRUE.
一个逻辑值表示是否要显示在屏幕上的图或不。如果为TRUE，X11（）（在Unix / Windows系统）或Macintosh（Mac）键，将调用内部函数。否则，它将绘制当前设备上的数字。默认值是TRUE。


作者（S）----------Author(s)----------


Hao Wu



举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
data(kidney)
# arrayview data on screen[屏幕上arrayview数据]
arrayview(kidney.raw, array=1)
graphics.off()
# arrayview raw data array 1 and 3 and output to postscript file[arrayview原始数据阵列1和3和输出到PostScript文件]
postscript(file="kidneyArrayview.ps")
arrayview(kidney.raw, array=c(1,3), onScreen=FALSE)

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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