plotVST(lumi)
plotVST()所属R语言包:lumi
plot the VST (Variance Stabilizing Transform) function
绘制VST(方差稳定变换)功能
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
plot the VST (Variance Stabilizing Transform) function of VST transformed LumiBatch object or parameters of VST function.
绘制的VST(方差稳定变换)功能的VST转换LumiBatch对象或VST功能参数。
用法----------Usage----------
plotVST(x, transFun = NULL, plotRange = NULL, addLegend = TRUE, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
a LumiBatch object after lumiT transform, or a matrix or data.frame with VST parameter
后lumiT变换LumiBatch的对象,或矩阵或数据框的VST参数
参数:transFun
a character vector of transformation function (asinh or log2)
转换功能的特征向量(ASINH或log2)
参数:plotRange
the plot range of untransformed data
图未转换的数据范围
参数:addLegend
add legend or not
添加图例或不
参数:...
other parameter used by plot function
plot功能使用的其他参数
值----------Value----------
invisibly return the untransformed and transformed values.
无形返回值的未转化和转化。
作者(S)----------Author(s)----------
Pan Du
参见----------See Also----------
vst
vst
举例----------Examples----------
## load example data[#加载数据为例]
data(example.lumi)
## Do default VST variance stabilizing transform[#默认的VST方差稳定变换]
lumi.T <- lumiT(example.lumi, ifPlot=TRUE)
## plot the transform function[#绘制变换功能。]
plotVST(lumi.T)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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