R语言 lumi包 lumiMethyStatus()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

lumiMethyStatus(lumi)
lumiMethyStatus()所属R语言包：lumi

                                         Estimate the methylation status of individual methylation sites
                                         估计个体的甲基化位点的甲基化状态

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Estimate the methylation status of individual methylation sites by fitting a two component Gamma mixture model for each sample
通过拟合两个组件伽玛每个样品的混合模型估计个体的甲基化位点的甲基化状态


用法----------Usage----------


lumiMethyStatus(methyLumiM, ...)



参数----------Arguments----------

参数：methyLumiM
a MethyLumiM class object
MethyLumiM类对象


参数：...
Other parameters used by methylationCall  
methylationCall使用其他参数


Details

详情----------Details----------

This function calls methylationCall and returns the methylation status of individual methylation sites. The methylation status includes: "Unmethy" (unmethylation probability > unmethylation threshold), "Methy" (methylation probability > methylation threshold), or "Margin". The methylation probability is returned as an attribute of "probability".
此函数调用methylationCall返回个体的甲基化位点的甲基化状态。甲基化状态包括：“Unmethy”（非甲基化的概率>甲基化阈值），“甲基”（甲基概率>甲基化阈值），或“保证金”。甲基化的几率则返回作为一个“概率”的属性。


值----------Value----------

return a methylation status matrix with "probability" attribute
“概率”属性返回的甲基化状态矩阵


作者（S）----------Author(s)----------



Pan Du




参见----------See Also----------

See Also methylationCall and gammaFitEM
methylationCall和gammaFitEM


举例----------Examples----------


data(example.lumiMethy)
methyCall <- lumiMethyStatus(example.lumiMethy)
head(methyCall)


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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。