R语言 lumi包 inverseVST()函数中文帮助文档(中英文对照)

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inverseVST(lumi)
inverseVST()所属R语言包：lumi

                                         Inverse VST transform
                                         逆的VST变换

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Inverse transform of VST (variance stabilizing transform), see vst.
伟仕逆变换（方差稳定变换），看到vst。


用法----------Usage----------


inverseVST(x, fun = c('asinh', 'log'), parameter)



参数----------Arguments----------

参数：x
a VST transformed LumiBatch object or a numeric matrix or vector
一个VST的转化LumiBatch对象或数字矩阵或向量


参数：fun
function used in VST transform  
使用的VST变换功能


参数：parameter
parameter of VST function  
VST功能参数


Details

详情----------Details----------

Recover the raw data from VST transformed data returned by vst. This function can be directly applied to the VST transformed or VST + RSN normalized LumiBatch object to reverse transform the data to the original scale.
从伟仕转化vst返回的数据恢复原始数据。此功能可直接应用的VST转换或VST + RSN的的规范化LumiBatch对象，以扭转转换数据到原来的规模。


值----------Value----------

Return the raw data before VST transform
返回之前的VST变换的原始数据


作者（S）----------Author(s)----------


Pan Du



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

vst
vst


举例----------Examples----------



## load example data[＃加载数据为例]
data(example.lumi)

## get the gene expression mean for one chip[＃基因表达的意思为一个芯片]
u <- exprs(example.lumi)[,1]
## get the gene standard deviation for one chip[＃得到一个芯片上的基因标准偏差]
std <- se.exprs(example.lumi)[,1]

## do variance stabilizing transform[＃方差稳定变换]
transformedU <- vst(u, std)

## do inverse transform and recover the raw data[＃逆变换，恢复原始数据]
parameter <- attr(transformedU, 'parameter')
transformFun <- attr(transformedU, 'transformFun')
recoveredU <- inverseVST(transformedU, fun=transformFun, parameter=parameter)

## compare with the raw data[＃与原始数据比较]
print(u[1:5])
print(recoveredU[1:5])

## do inverse transform of the VST + RSN processed data[＃做逆变换的VST + RSN的处理数据]
lumi.N <- lumiExpresso(example.lumi[,1:2])
## Inverse transform. [＃逆变换。]
## Note: as the normalization is involved, the processed data will be different from the raw data.[＃注：参与标准化，处理后的数据将是从不同的原始数据。]
lumi.N.raw <- inverseVST(lumi.N)


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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。