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R语言 lumi包 IlluminaID2nuID()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 23:45:44 | 显示全部楼层 |阅读模式
IlluminaID2nuID(lumi)
IlluminaID2nuID()所属R语言包:lumi

                                         Matching Illumina IDs to nuID based on Illumina ID mapping library
                                         Illumina公司的ID匹配基于Illumina的ID映射库nuID

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Matching Illumina IDs to nuID based on Illumina ID mapping libraries.
Illumina的标识匹配以nuID基于Illumina的ID映射库。


用法----------Usage----------


IlluminaID2nuID(IlluminaID, lib.mapping=NULL, species = c("Human", "Mouse", "Rat", "Unknown"), chipVersion = NULL, ...)



参数----------Arguments----------

参数:IlluminaID
a vector of Illumina IDs  
Illumina的标识向量


参数:lib.mapping
the ID mapping library. If it is provided, the parameter "species" will be ignored.  
ID映射库。如果它提供的参数将被忽略“物种”。


参数:species
the species of the chip designed for. If users do not know it, it can be set as "Unknown".  
设计的芯片的物种。如果用户不知道它,它可以设置为“未知”。


参数:chipVersion
chipVersion information returned by function getChipInfo   
函数getChipInfo chipVersion返回的信息


参数:...
other parameters of getChipInfo  
其他参数getChipInfo


Details

详情----------Details----------

When the parameter "chipVersion" is not provided, this function basically returned the "idMapping" item returned by function getChipInfo.
当参数“chipVersion”不提供这一功能基本上返回“idMapping的”项目功能getChipInfo返回的。


值----------Value----------

The mapping information from Illumina ID to nuID. It will be a matrix with each column corresponding to one matched manifest file when parameter "returnAllMatches" is TRUE. In this case, the columns are sorted from the best match to worst. If IlluminaID is NULL and chipVersion is provided, it will return all mapping information of the chip.
从Illumina的ID映射信息nuID。这将是一个矩阵每列对应一个匹配的manifest文件时参数“returnAllMatches”为TRUE。在这种情况下,列排序从最佳匹配到最差。如果IlluminaID是NULL,提供chipVersion,它会返回所有的映射信息的芯片。


作者(S)----------Author(s)----------


Pan Du



参见----------See Also----------

getChipInfo, nuID2IlluminaID
getChipInfo,nuID2IlluminaID

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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