estimateLumiCV(lumi)
estimateLumiCV()所属R语言包:lumi
Estimate the coefficient of variance matrix of LumiBatch object
估计方差矩阵LumiBatch对象的系数
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Estimate the coefficient of variance matrix of LumiBatch object for each measurement or probe.
LumiBatch对象方差矩阵的估计系数为每个测量或探测。
用法----------Usage----------
estimateLumiCV(x.lumi, type = c("measurement", "probe"), ifPlot = FALSE, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x.lumi
a LumiBatch object
1 LumiBatch对象
参数:type
estimate the coefficient of variance of each measurement or each probe
估计每个测量的方差系数或每个探针
参数:ifPlot
determince whether to plot the density plot or not
determince是否绘制密度图或不
参数:...
optional arguments to plot.
plot可选参数。
Details
详情----------Details----------
By default, the coefficient of variance is the ratio of the mean and variance of the bead expression values. Basically, it is the ration of exprs and se.exprs element of LumiBatch object. If the type is "probe", it is the ratio of the mean and variance of probe expression profile.
默认情况下,变异系数是珠的表达值的均值和方差的比例。基本上,它是exprs和se.exprsLumiBatch对象元素的口粮。如果类型是“探针”,它是探针表达谱的均值和方差的比例。
值----------Value----------
A matrix of coefficient of variance
变异系数矩阵
作者(S)----------Author(s)----------
Pan Du
参见----------See Also----------
lumiQ
lumiQ
举例----------Examples----------
## load example data[#加载数据为例]
data(example.lumi)
## estimate the coefficient of variance and plot the density plot of it[#估计的变异系数,并绘制它的密度图]
cv <- estimateLumiCV(example.lumi, ifPlot = TRUE)
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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