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R语言 lumi包 bgAdjust()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 23:42:26 | 显示全部楼层 |阅读模式
bgAdjust(lumi)
bgAdjust()所属R语言包:lumi

                                         Background adjustment for Illumina data
                                         Illumina的数据为背景调整

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The method adjusts the data by subtracting an offset, which is estimated based on the quantile of the control probes
该方法调整减去一个偏移量,这是基于控制探针位数估计的数据


用法----------Usage----------


bgAdjust(lumiBatch, probs = 0.5, ...)



参数----------Arguments----------

参数:lumiBatch
A LumiBatch object with controlData slot include control probe information  
与controlData插槽LumiBatch对象包括控制探针信息


参数:probs
The quantile used to estimate the background  
用来估计背景的位数


参数:...
other parameters used by quantile method  
其他quantile方法使用的参数


Details

详情----------Details----------

The method adjusts the data by subtracting an offset, which is estimated based on the quantile of the control probes. The control probe information is kept in the controlData slot of the LumiBatch object. If no control data information, the method will do nothing.
该方法通过减去一个偏移量,这是基于控制探针位数估计调整的数据。控制传感器的信息被保存在的LumiBatch对象controlData插槽。如果没有控制数据信息,该方法将无能为力。


值----------Value----------

It returns a LumiBatch object with background adjusted.
它返回调整与背景LumiBatch对象的。


作者(S)----------Author(s)----------


Pan Du



参见----------See Also----------

lumiB
lumiB


举例----------Examples----------


        data(example.lumi)
        ## Here will assume the minimum of the control probe as the background,[#这里将承担最低控制探针为背景,]
        ##    because there is no negative control (blank beads) information for the Barnes data.[#因为有没有阴性对照组(空白珠)为巴恩斯数据的信息。]
        example.lumi.b <- bgAdjust(example.lumi, probs=0)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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