R语言 lol包 lmMatrixFit()函数中文帮助文档(中英文对照)

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lmMatrixFit(lol)
lmMatrixFit()所属R语言包：lol

                                         Multiple lm fit for penalized regressions
                                         惩罚回归多个LM适合

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Refit the regressions given matrices of responses, predictors, and the coefficients/interactions matrix. This is typically used after the lasso, since the coefficients were shrinked.
改装的反应，预测，系数/相互作用矩阵的矩阵的回归。这通常用套索后，缩小以来系数。


用法----------Usage----------


lmMatrixFit(y, x = NULL, mat, th = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：y
Input response matrix, typically expression data with genes/variables in columns and samples/measurements in rows.  Or when input x is NULL, y should be an object of two lists: y: expression data and x: copy number data  
输入响应矩阵，通常的表达与基因/列和行的样品/测量变量的数据。或输入x是NULL时，y应该是两个列表的对象：Y：表达数据和X：拷贝数数据


参数：x
Input predictor matrix, typically copy number data, genes/predictors in columns and samples/measurements in rows. Can be NULL  
输入预测矩阵，通常复制数字数据，基因在列和行的样品/测量/预测。可以为NULL


参数：mat
Coefficient matrix, number of columns is the number of predictors (y) and number of rows is the number of responses (x)  
系数矩阵，列数是预测数（y）和行数的反应数量（x）


参数：th
The threshold to use in order to determine which coefficients are non-zero, so the corresponding predictors are used  
以确定哪些系数不为零，所以相应的预测是用来使用阈值


值----------Value----------


参数：coefMat
A coefficient matrix, rows are responses and columns are predictors
一个系数矩阵，行响应和列预测


参数：resMat
A residual matrix, each row is the residuals of a response.
剩余的矩阵，每一行是一个响应的残差。


参数：pvalMat
Matrix of p-values for each coefficients
每个系数矩阵P值


作者（S）----------Author(s)----------



Yinyin Yuan




参见----------See Also----------

lm, matrixLasso
LM，matrixLasso


举例----------Examples----------


data(chin07)
data <- list(y=t(chin07$ge), x=t(chin07$cn))
res <- matrixLasso(data, method='cv', nFold=5)
res
res.lm <- lmMatrixFit(y=data, mat=abs(res$coefMat), th=0.01)
res.lm

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