R语言 logitT包 logitTAffy()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

logitTAffy(logitT)
logitTAffy()所属R语言包：logitT

                                         Testing for differential gene expression using the Logit-t algorithm
                                         测试使用罗吉特-T算法的差异表达基因

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes an instance of AffyBatch and calculates t-statistics  for tests of differential gene expression for oligonucleotide arrays using the Logit-t algorithm.
此功能需要一个AffyBatch实例，计算t-统计的差异表达基因的寡核苷酸阵列使用罗吉特-T算法的测试。


用法----------Usage----------


logitTAffy(object, group)



参数----------Arguments----------

参数：object
an instance of AffyBatch  
一个AffyBatch的实例


参数：group
a vector specifying the group label for each array  
矢量指定为每个阵列组标签


Details

详情----------Details----------

For more details see the package vignette.  
欲了解更多详情，见包的小插曲。


值----------Value----------

A named vector containing the t-statistics for each probe set for each array.
命名的向量，包含t-统计量为每个探针设置为每个阵列。


作者（S）----------Author(s)----------


Tobias Guennel <a href="mailto:tguennel@vcu.edu">tguennel@vcu.edu</a>



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

AffyBatch
AffyBatch


举例----------Examples----------


if(require(SpikeInSubset)){
library(SpikeInSubset)
data(spikein95)
logitTex<-logitTAffy(spikein95, group=c("A","A","A","B","B","B"))
logitTex[1:10]                                                              # extract t-statistics for first ten probe sets[提取前10个探针组的t-统计]
logitTex[grep("AFFX-BioB-5_at",names(logitTex))]                         # extract t-statistics for specific probe set[提取特定的探针组的t-统计]
pvals&lt;-(1-pt(abs(logitTex),df=4))*2                                         # calculate two-sided p-values[计算双面p值]
signifgenes&lt;-names(logitTex)[pvals&lt;0.01]                                    # find significant probe sets at 0.01 significance level[在0.01显着水平显着探针集]
}else{
stop("Please install the SpikeInSubset package to run the example.")
}

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。