R语言 LMGene包 plotMeanSD()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plotMeanSD(LMGene)
plotMeanSD()所属R语言包：LMGene

                                         Plotting function for gene means and standard deviations
                                         绘图功能基因手段和标准偏差

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots the row standard deviation of a matrix of expression data against the row mean, or the rank of the row mean.
图表达对行数据矩阵行标准偏差是什么意思，或该行的排名是什么意思。


用法----------Usage----------


plotMeanSD(indata, by.rank = TRUE, line = FALSE, ymax = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：indata
An object of class matrix, data.frame, ExpressionSet, or AffyBatch  
一个对象类matrix，data.frame，ExpressionSet或AffyBatch


参数：by.rank
If TRUE, the row standard deviations are plotted against the ranks of the row means.  Otherwise, the row standard deviations are plotted against the row means themselves.  
如果TRUE，该行的标准偏差是针对该行的行列绘制手段。否则，该行的标准偏差暗算行意味着自己。


参数：line
If TRUE, a lowess smoother line is drawn on the plot.  
如果TRUE，LOWESS流畅的线绘制图。


参数：ymax
The upper limit for the plot y-axis.  If missing, axis limits are generated automatically by plot.  
图Y轴的上限。如果丢失，自动生成轴限制plot。


Details

详情----------Details----------

Generates a scatter plot of the row standard deviations of a matrix of expression data against the row means or ranks of the row means.
生成一个散点图表达数据或行的手段对行手段行列矩阵行标准偏差。


值----------Value----------

NULL
为NULL


作者（S）----------Author(s)----------



Rachel Chen and Blythe Durbin-Johnson




举例----------Examples----------


library(LMGene)
library(Biobase)

data(sample.eS)
# transform data[转换数据]
trans.eS <- transeS(sample.eS, lambda = 727, alpha = 56)

# plot SD against rank of mean[对图的SD平均排名]
plotMeanSD(trans.eS, line = TRUE)
plotMeanSD(sample.eS, line = TRUE, ymax = 1000)

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