lnorm(LMGene)
lnorm()所属R语言包:LMGene
Lowess normalization function
LOWESS标准化的功能
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Lowess normalization function
LOWESS标准化的功能
用法----------Usage----------
lnorm(mat1, span = 0.1)
参数----------Arguments----------
参数:mat1
A data matrix to be normalized
一个数据矩阵进行标准化
参数:span
Lowess smoother span. Larger values give more smoothness.
LOWESS平滑的跨度。值越大,给更多的平滑。
Details
详情----------Details----------
mat1 must be a p by n matrix, where p is the number of genes and n is the number of arrays or samples
mat1必须是一个pn矩阵,p是基因的数量和n是数组或样本数量
值----------Value----------
参数:matnorm1
Normalized matrix
归一化矩阵
作者(S)----------Author(s)----------
David Rocke and Geun-Cheol Lee
参考文献----------References----------
<h3>See Also</h3>
举例----------Examples----------
library(Biobase)
library(LMGene)
#data[数据]
data(sample.mat)
data(vlist)
raw.eS <- neweS(sample.mat, vlist)
# glog transform data[glog变换数据]
trans.eS <- transeS(raw.eS, lambda = 727, alpha = 56)
# normalize[标准化]
normed.exprs <- lnorm(exprs(trans.eS))
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|