glog(LMGene)
glog()所属R语言包：LMGene
Generalized log transformation function
广义log转换功能
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function transforms the input values by the generalized log function.
此功能转换的输入值由广义的log功能。
用法----------Usage----------
glog(y, lambda)
参数----------Arguments----------
参数：y
A data matrix
数据矩阵
参数：lambda
Transformation parameter
转换参数
Details
详情----------Details----------
The glog transformation of a variable y is defined as log(y + sqrt(y^2 + lambda)). Using lambda = 0 corresponds to the log transformation, up to a scale factor of 2. (Other, equivalent expressions exist for the glog transformation. See Durbin et al. (2002) and Huber et al. (2002) for futher details.)
定义一个变量y glog转型为log(y + sqrt(y^2 + lambda))。使用lambda = 0对应数转换，比例因子为2。 （相当于表达式存在为glog转型。德宾等人（2002）和Huber等人（2002年），为进一步的细节。）
The input matrix y may be modified prior to transformation by subtracting a constant or vector ("alpha"). The parameters lambda and alpha may be estimated from tranest.
输入矩阵y减去一个常数或向量（“alpha”）改造前可以修改。参数lambda和alpha可估计从tranest。
值----------Value----------
参数：yt
A matrix of glog-transformed values
glog转化值矩阵
作者（S）----------Author(s)----------
David Rocke and Geun-Cheol Lee
参考文献----------References----------
data, Bioinformatics, 18, S105–S110.
stabilization applied to microarray data calibration and to the quantification of differential expression, Bioinformatics, 18, S96–S104.
参见----------See Also----------
tranest, transeS
tranest，transeS
举例----------Examples----------
#library[图书馆]
library(Biobase)
library(LMGene)
#data[数据]
data(sample.mat)
sample.mat[1:5,1:4]
GloggedSmpd<-glog(sample.mat-50,500)
GloggedSmpd[1:5,1:4]
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发表于 2012-2-25 23:31:03
