R语言 LiquidAssociation包 plotGLA-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plotGLA-methods(LiquidAssociation)
plotGLA-methods()所属R语言包：LiquidAssociation

                                         The function plots scatter plots of two variables conditioning on the value of a third variable.
                                         两个变量的空调上的第三个变量的值函数图散点图。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

'plotGLA' is a function to plot the scatter plots of two variables conditioning on the value of a third variable.
“plotGLA”是一个功能上绘制两个变量的空调第三个变量的值的散点图。


参数----------Arguments----------

参数：object
An numerical matrix object with three columns or an object of ExpresionSet class with three features..
一个具有三列或对象三个特点ExpresionSet类的数值矩阵对象......


参数：cut
cut==M +1. M is the number of grip points pre-specifed over the third variable .
切== M +1个。 M是在第三个变量的预specifed握点的数量。


参数：dim
An index of the column for the gene to be treated as the third controller variable.
第三控制器变量被视为一个基因的列的索引。


参数：filen
The file name for the output graph can be specified when save=TRUE
输出图的文件名，可以指定保存时= TRUE，


参数：save
If save=TRUE then output graphs will be save as PDF files with file name as specified by filen.
如果保存= TRUE，则输出图将被保存为文件名的PDF文件filen指定。


参数：geneMap
A character vector with three elements representing the mapping between gene names and feature names (optional).
三个基因的名称和功能名称（可选）之间的映射元素代表一个字符向量。


参数：...
Other graphical parameters can be passed to function plot.
其他图形参数可以传递给函数的图形。


Details

详情----------Details----------

The input object can be a numerical matrix with three columns with row representing observations and column representing three variables. It can also be an ExpressionSet object with three features. More detail example about the usage of geneMap is demonstrated in the vignette.
输入对象可以是一个三列与行代表的意见和列代表三个变量的数值矩阵。它也可以是一个具有三个特点ExpressionSet对象。更多关于使用geneMap详细的例子证明中的小插曲。


作者（S）----------Author(s)----------


Yen-Yi Ho



参考文献----------References----------

183. http://www.bepress.com/jhubiostat/paper183

举例----------Examples----------


data<-matrix(rnorm(300), ncol=3)

colnames(data)<-c("Gene1", "Gene2", "Gene3")

plotGLA(data, cut=3, dim=3, pch=16, filen="GLAplot", save=FALSE)


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