R语言 limma包 write.fit()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

write.fit(limma)
write.fit()所属R语言包：limma

                                        Write MArrayLM Object to a File
                                         写MArrayLM对象文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Write a microarray linear model fit to a file.
写一个文件到一个芯片的线性模型的拟合。


用法----------Usage----------


write.fit(fit, results=NULL, file, digits=3, adjust="none", method="separate", F.adjust="none", sep="\t", ...)



参数----------Arguments----------

参数：fit
object of class MArrayLM containing the results of a linear model fit
类的对象MArrayLM包含一个线性模型的拟合结果


参数：results
object of class TestResults
对象类TestResults


参数：file
character string giving name of file
文件名称的字符串，


参数：digits
integer indicating precision to be used
要使用整数，指示精度


参数：adjust
character string specifying multiple-testing adjustment method for the t-statistic P-values, e.g., "BH". See p.adjust for the available options. If NULL or "none" then the P-values are not adjusted.
字符串指定多个测试调整方法为t-统计量的P值，例如，"BH"。看到p.adjust可用的选项。如果NULL或"none"P值是不进行调整。


参数：method
character string, should the P-value adjustment be "global" or "separate" for each contrast.
字符串，应调整P值是"global"或"separate"每个对比。


参数：F.adjust
character string specifying adjustment method for the F-statistic P-values.
字符串指定为F-统计量P值的调整方法。


参数：sep
the field separator string. Values in the output file will be separated by this string.
字段分隔符字符串。在输出文件中的值将被分隔此字符串。


参数：...
other arguments are passed to write.table
其他的参数被传递write.table


Details

详情----------Details----------

This function writes a tab-delimited text file containing for each gene (1) the average log-intensity, (2) the log-ratios, (3) moderated t-statistics, (4) t-statistic P-values, (5) F-statistic if available, (6) F-statistic P-values if available, (7) classification if available and (8) gene names and annotation.
这个函数写一个制表符分隔的文本文件含有每个基因（1）平均log强度，（2）log比率，（3）主持的t-统计量，（4）t-统计量的P-值，（5如果可用）F-统计，（6）F统计量的P-值，如果可用，如果可用，（8）基因的名称和注释（7）分类。


值----------Value----------

No value is produced but a file is written to the current working directory.
没有价值的产生，但一个文件被写入到当前的工作目录。


作者（S）----------Author(s)----------


Gordon Smyth



参见----------See Also----------

write in the base library.
write基库。

An overview of linear model functions in limma is given by 06.LinearModels.
线性模型功能概述limma由06.LinearModels给出。

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。