R语言 limma包 symbols2indices()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

symbols2indices(limma)
symbols2indices()所属R语言包：limma

                                        Convert Gene Set Symbols to Indices
                                         转换基因组符号指数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Make a list of gene set symbols into a list of gene sets indices.
使之成为一个基因组指数列表基因组符号的列表。


用法----------Usage----------


symbols2indices(gene.sets, symbols, remove.empty=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：gene.sets
list of character vectors, each vector containing the symbols for a set of genes.
特征向量的列表，每个包含的符号为一组基因的向量。


参数：symbols
character vector of gene symbols.
基因符号特征向量。


参数：remove.empty
logical, should sets of size zero be removed from the output?
逻辑，应该套大小为零，从输出中删除吗？


Details

详情----------Details----------

This function used to create input for romer function. Typically, symbols is the vector of symbols of genes on a microarray, and gene.sets is obtained constructed from a database of gene sets, for example a representation of the Molecular Signatures Database (MSigDB) downloaded from http://bioinf.wehi.edu.au/software/MSigDB.
此功能使用创建romer函数的输入。通常情况下，symbols是一个芯片上的基因符号的向量，和gene.sets得到构建从基因组数据库，例如一个分子签名数据库（MSigDB）的代表，从HTTP下载： / / bioinf.wehi.edu.au的/软件/ MSigDB的。


值----------Value----------

list of integer vectors, each vector containing the indices of a gene set in the vector symbols.
列表整数向量，每个向量含有基因矢量symbols的指数。


作者（S）----------Author(s)----------


Gordon Smyth and Yifang Hu



参见----------See Also----------

romer,mroast
romer，mroast

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。