R语言 limma包 readSpotTypes()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

readSpotTypes(limma)
readSpotTypes()所属R语言包：limma

                                        Read Spot Types File
                                         读点类型的文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Read a table giving regular expressions to identify different types of spots in the gene-dataframe.
读表正则表达式确定基因dataframe点的不同类型。


用法----------Usage----------


readSpotTypes(file="SpotTypes.txt",path=NULL,sep="\t",check.names=FALSE,...)



参数----------Arguments----------

参数：file
character string giving the name of the file specifying the spot types.
字符串的指定当场类型的文件名称。


参数：path
character string giving the directory containing the file. Can be omitted if the file is in the current working irectory.  
字符串，包含文件的目录。如果该文件是在当前的工作irectory可以省略。


参数：sep
the field separator character
字段分隔符


参数：check.names
logical, if FALSE column names will not be converted to valid variable names, for example spaces in column names will not be left as is
逻辑，如果FALSE列名不会被转换为有效的变量名，列名例如位将不会被保留


参数：...
any other arguments are passed to read.table
任何其他参数传递read.table的


Details

详情----------Details----------

The file is a text file with rows corresponding to types of spots and the following columns: SpotType gives the name for the spot type, ID is a regular expression matching the ID column, Name is a regular expression matching the Name column, and Color is the R name for the color to be associated with this type.
该文件是文本文件与相应类型的斑点和下面的列行：SpotType给当场类型的名称，ID是一个正则表达式匹配的ID列，Name是一个正则表达式匹配的名称列，和Colorŕ名称与此类型相关联的颜色。


值----------Value----------

A data frame with columns
与列的数据框


参数：SpotType
character vector giving names of the spot types
字符向量提供当场类型的名


参数：ID
character vector giving regular expressions
给正则表达式的字符向量


参数：Name
character vector giving regular expressions
给正则表达式的字符向量


参数：Color
character vector giving names of colors
特征向量，颜色的名称


作者（S）----------Author(s)----------


Gordon Smyth following idea of James Wettenhall



参见----------See Also----------

An overview of LIMMA functions for reading data is given in 03.ReadingData.
在03.ReadingData一个读取数据LIMMA功能的概述。

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