R语言 limma包 plotSA()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotSA(limma)
plotSA()所属R语言包：limma

                                        Sigma vs A plot for microarray linear model
                                         西格玛与芯片线性模型图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plot log residual standard deviation versus average log expression for a fitted microarray linear model.
绘制登录剩余标准差与一个装有芯片的线性模型的平均log表达。


用法----------Usage----------


plotSA(fit, xlab="Average log-expression", ylab="log2(sigma)", zero.weights=FALSE, pch=16, cex=0.2, ...)



参数----------Arguments----------

参数：fit
an MArrayLM object.
MArrayLM对象。


参数：xlab
character string giving label for x-axis
字符串给X轴的标签


参数：ylab
character string giving label for y-axis
为y轴的标签的字符串，


参数：pch
vector or list of plotting characters. Default is integer code 16 which gives a solid circle.
向量或列表绘制字符。默认是整数代码16给出了一个实心圆。


参数：cex
numeric expansion factor for plotting character.  Defaults to 0.2.
绘制字符的数字膨胀系数。默认为0.2。


参数：zero.weights
logical, should spots with zero or negative weights be plotted?
逻辑，应绘制点与零或负重量吗？


参数：...
any other arguments are passed to plot
任何其他参数传递plot的


Details

详情----------Details----------

This plot is used to check the mean-variance relationship of the expression data, after fitting a linear model.
此图是用来表达数据的均值 - 方差关系，拟合线性模型后检查。

See points for possible values for pch and cex.
看到points可能pch和cex值。


值----------Value----------

A plot is created on the current graphics device.
当前图形设备上创建一个图。


作者（S）----------Author(s)----------


Gordon Smyth



参见----------See Also----------

An overview of diagnostic functions available in LIMMA is given in 09.Diagnostics.
诊断功能概述在LIMMA提供给在09.Diagnostics。

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