R语言 limma包 EList-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

EList-class(limma)
EList-class()所属R语言包：limma

                                        Expression List - class
                                         表达名单 - 类

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Simple list-based classes for storing expression values (E-values) for a set of one-channel microarrays. EListRaw holds expression values on the raw scale. EList holds expression values on the log scale, usually after background correction and normalization. EListRaw objects are normally created by read.maimages. In the future, EList objects are likely to be created normalizeBetweenArrays.
简单的基于列表的类，用于存储表达式的值（E值）的一个通道芯片集。 EListRaw拥有上规模的原始的表达值。 EList持有表达对数刻度值，通常要经过背景校正和规范化。 EListRaw对象通常创建read.maimages。在未来，EList对象是可能要创建normalizeBetweenArrays。


角子机/列表组件----------Slots/List Components----------

EList objects can be created by new("EList",E) where E is a list. These classes contains no slots (other than .Data), but objects should contain a list component E as follows:
EListnew("EList",E)E是一个列表可以通过创建对象。这些类不包含插槽（除“.Data），但对象应该包含一个列表组件E如下：

Optional components include:
可选组件包括：

numeric matrix of same dimensions as E containing relative spot quality weights.  Elements should be non-negative.
E含有相对现货质量重量尺寸相同的数字矩阵。元素应该非负。

list containing other matrices, all of the same dimensions as E.
列表，其中包含其他矩阵，所有的E相同的尺寸。

data.frame containing probe information. Should have one row for each probe. May have any number of columns.
数据框包含探针信息。应该有一个为每个探测行。可能有任何的列数。

Valid EList or EListRaw objects may contain other optional components, but all probe or array information should be contained in the above components.
有效的EList或EListRaw对象可能包含其他可选组件，但所有的探针或阵列的信息应包含在上述组件。


方法----------Methods----------

These classes inherit directly from class list so any operation appropriate for lists will work on objects of this class. In addition, EList objects can be subsetted and combined. EList objects will return dimensions and hence functions such as dim, nrow and ncol are defined.  ELists also inherit a show method from the virtual class LargeDataObject, which means that ELists will print in a compact way.
这些类直接继承自类list所以适当列表的任何操作，将这个类的对象。此外，可以EList对象子集和组合。 EList对象将返回尺寸和功能，如dim，nrow和ncol定义。 ELists还show方法继承虚拟类LargeDataObject，这意味着ELists将打印在一个紧凑的方式。


作者（S）----------Author(s)----------


Gordon Smyth



参见----------See Also----------

02.Classes gives an overview of all the classes defined by this package.
02.Classes给出了一个概述此包中定义的所有类。

ExpressionSet is a more formal class in the Biobase package.
ExpressionSet是一个中的BIOBASE包更正式的类。

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。