ci,Les-method(les)
ci,Les-method()所属R语言包：les
ci
CI
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Computes confidence intervals (CI) for Lambda using bootstrapping.
计算Lambda使用自举置信区间（CI）。
用法----------Usage----------
ci(object, subset, nBoot = 100, conf = 0.95, nCores = NULL, ...)
## S4 method for signature 'Les'
ci(object, subset, nBoot = 100, conf = 0.95, nCores =
NULL, ...)
参数----------Arguments----------
参数：object
Object of class 'Les' as returned by 'estimate' or 'regions'.
返回“估计”或“区域”类“莱斯”的对象。
参数：subset
Vector of logical specifying the probes for which the CIs should be computed. If missing CIs will be computed for all probes.
逻辑向量指定为独联体应计算探针。如果遗失证明书，将计算所有探针。
参数：nBoot
Integer specifying the number of bootstrap samples (default: 100). For details see 'boot' from the 'boot' package.
整数，指定引导样品的数量（默认值：100）。有关详细信息，请参阅从启动包引导。
参数：conf
Numeric specifying the confidence level (default: 0.95). For details see 'boot' from the 'boot' package.
数字指定的信任级别（默认：0.95）。有关详细信息，请参阅从启动包引导。
参数：nCores
Integer indicating the number of cores to use for computation. This feature requires the 'multicore' package which is only available for certain platforms. The package is used only if 'library(multicore)' has been called manually by the user before and if 'nCores' is an integer unequal NULL specifying the number of cores to use. The value is passed directly to 'mclapply' as argument 'n.cores'. For details and benefits please see the 'Details' section.
整数，指示内核数量计算使用。此功能要求的多核包这是只适用于某些平台。只有当库（多核）已要求用户手动“nCores”是一个整数的不平等NULL，指定使用的核心数量之前，如果使用的包。 “mclapply”参数“n.cores”的值被直接传递。请参阅“详细资料”部分的细节和福利。
参数：...
Further arguments passed to subsequent functions.
进一步的参数传递给后续的功能。
Details
详情----------Details----------
The 'ci' method computes confidence intervals (CI) by bootstrapping probes in each window. Since based on percentiles the resulting CIs are asymmetrical.
“CI”方法计算，引导探针在每个窗口的置信区间（CI）。自上百分的基础上产生的证明书是不对称的。
All arguments for computation are taken from 'object' and thereby kept the same as for the results from 'estimation'.
计算所有参数均取自“对象”，从而保持了从估计的结果相同。
Since bootstrapping is computational demanding and CIs are often only wanted for certain regions of interest it may be useful to restrict computation with the 'subset' argument.
由于引导是计算的苛刻和独联体往往只对某些区域的利益想，它可能是有用的限制与计算“子集”的说法。
The 'multicore' package can be used to spread the computation over several cores in a simple way. This can be useful on multi-core machines for large datasets or computation of confidence intervals for many probes. The 'multicore' package is not available on all platforms. To use multicore processing 'library(multicore)' has to be called beforehand and a number of cores to use has to be specified in 'nCores'. For details see the documentation of the 'multicore' package.
多核包可以用来散布在多个内核在一个简单的方法计算。多核心机的大型数据集或多个探针的置信区间的计算，这可能是有用的。 多核包是不是所有平台上都可用。使用多核处理“图书馆（多核）”被称为事前的核心数使用，必须指定nCores。有关详细信息，请参阅“多核”一揽子文件。
值----------Value----------
Object of class 'Les' with additionally filled slots: ci, subset, nBoot, conf
对象类“莱斯”此外填充插槽：CI，子集，nBoot，CONF
作者（S）----------Author(s)----------
Julian Gehring
Maintainer: Julian Gehring <julian.gehring@fdm.uni-freiburg.de>
参见----------See Also----------
Package: les-package boot
包装：les-packageboot
Class: Les
类别：Les
Methods and functions: Les estimate threshold regions ci chi2 export plot
方法和功能：Lesestimatethresholdregionscichi2exportplot
举例----------Examples----------
data(spikeInStat)
x <- Les(pos, pval)
x <- estimate(x, win=200, grenander=FALSE)
subset <- pos >= 5232300 & pos <= 5233200
x <- ci(x, subset, conf=0.90, nBoot=50)
plot(x, error="ci")
## Not run: [＃无法运行：]
## multicore computation[＃多核计算]
## only available on certain platforms[＃只适用于某些平台]
library(multicore)
x <- ci(x, subset=150:200, conf=0.90, nBoot=50, nCores=2)
## End(Not run)[＃结束（不运行）]
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发表于 2012-2-25 23:06:11
