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R语言 KEGGgraph包 mergeKEGGgraphs()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 22:57:47 | 显示全部楼层 |阅读模式
mergeKEGGgraphs(KEGGgraph)
mergeKEGGgraphs()所属R语言包:KEGGgraph

                                         Merge KEGG graphs, also merging KEGGNode and KEGGEdge attributes
                                         KEGG图表合并,也合并KEGGNode和KEGGEdge属性

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

mergeKEGGgraphs extends function mergeGraphs and merges a list of KEGG graphs. Both mergeGraphs and mergeKEGGgraphs can be used to merge graphs, while the latter form is able to merge the nodes and edges attributes from KEGG, so that the nodes and edges have a one-to-one mapping to the results from getKEGGnodeData and getKEGGEdgeData.
mergeKEGGgraphs扩展功能mergeGraphs和合并一个KEGG图列表。既mergeGraphs和mergeKEGGgraphs可以用来合并的图形,而后者的形式是能够合并KEGG的节点和边的属性,使节点和边有一个一对一映射getKEGGnodeData和getKEGGEdgeData的结果。

See details below.
详见下文。


用法----------Usage----------


mergeKEGGgraphs(list, edgemode = "directed")



参数----------Arguments----------

参数:list
A list of named KEGG graphs
的名为KEGG图列表


参数:edgemode
character, 'directed' by default
字符,默认情况下,“定向”


Details

详情----------Details----------

mergeGraphs discards the node or edge attributes, hence getKEGGnodeData or getKEGGedgeData will return NULL on the resulting graph.
mergeGraphs丢弃的节点或边的属性,因此getKEGGnodeData或getKEGGedgeData将返回NULL生成的图形。

mergeKEGGgraphs calls mergeGraphs first to merge the graphs, then it also merges the KEGGnodeData and KEGGedgeData.so that they are one-to-one mapped to the nodes and edges in the merged graph.
mergeKEGGgraphs要求mergeGraphs第一次合并图表,那么它也合并的KEGGnodeData,并KEGGedgeData.so,他们一到映射到在合并后的图的节点和边。


值----------Value----------

A graph with nodeData and edgeData
与nodeData和edgeData的图形


作者(S)----------Author(s)----------


Jitao David Zhang <a href="mailto:jitao_david.zhang@roche.com">mailto:jitao_david.zhang@roche.com</a>



参见----------See Also----------

mergeGraphs
mergeGraphs


举例----------Examples----------


sfile <- system.file("extdata/hsa04010.xml",package="KEGGgraph")
gR <- parseKGML2Graph(sfile,expandGenes=TRUE)

wntfile <- system.file("extdata/hsa04310.xml",package="KEGGgraph")
wntR <- parseKGML2Graph(wntfile, expandGenes=TRUE)

graphlist <- list(mapkG=gR, wntG=wntR)
mergedKEGG <- mergeKEGGgraphs(graphlist)

mergedKEGG

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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