R语言 KEGGgraph包 getReactions-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getReactions-methods(KEGGgraph)
getReactions-methods()所属R语言包：KEGGgraph

                                        Get KEGG reactions
                                         获取KEGG反应

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

In KGML, the pathway element specifies one graph object with the entry elements as its nodes and the relation and reaction elements as its edges. The relation elements are saved as edges in objects of KEGGPathway-class, and the reactions elements are saved as a slot of the object, which can be retrieved with the function getReactions.
在KGML，通路元素指定一个图形对象作为其节点和其边缘的关系和反应元素entry元素。关系元素保存边缘KEGGPathway-class的对象，和反应元素为对象的插槽，可与检索功能getReactions保存。

Regulatory pathways are always viewed as protein networks, so there is no 'reaction' information saved in their KGML files. Metabolic pathways are viewed both as both protein networks and chemical networks, hence the KEGGPathway-class object may have reactions information.
总是被视为蛋白质网络监管途径，因此，有没有“反应”的信息保存他们KGML文件。代谢途径被视为蛋白质网络和化工网络，因此KEGGPathway-class对象可能有反应信息。


方法----------Methods----------




object = "KEGGPathway"  An object of KEGGPathway-class
对象=“KEGGPathway”一个KEGGPathway-class的对象


作者（S）----------Author(s)----------


Jitao David Zhang <a href="mailto:jitao_david.zhang@roche.com">mailto:jitao_david.zhang@roche.com</a>



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>

举例----------Examples----------


mapfile <- system.file("extdata/map00260.xml", package="KEGGgraph")
maptest <- parseKGML(mapfile)
maptest

mapReactions <- getReactions(maptest)
mapReactions[1:3]

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注：
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