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R语言 KEGGgraph包 getKEGGnodeData()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 22:53:15 | 显示全部楼层 |阅读模式
getKEGGnodeData(KEGGgraph)
getKEGGnodeData()所属R语言包:KEGGgraph

                                         Get or set list of KEGG node or edge data
                                         获取或设置的KEGG节点或边缘数据列表

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The 'get' methods extracts KEGG node (edge) attributes from a graph produced by calling parseKGML2Graph or KEGGpathway2Graph. The 'set' methods writes a list into the edge or node data.
“获取”的方法提取KEGG调用parseKGML2Graph或KEGGpathway2Graph制作了一个图表节点(边)属性。 集的方法,边或节点数据写入一个列表。


用法----------Usage----------


getKEGGnodeData(graph, n)
getKEGGedgeData(graph, n)



参数----------Arguments----------

参数:graph
a graph object by parsing KGML file, where KEGG node and edge attributes are maintained
由图解析KGML文件在KEGG节点和边的属性,其中对象保持


参数:n
optional character string, name of the desired node or edge. If is missing all node Data is returned
可选字符串,所需的节点或边的名称。如果是丢失了所有节点的数据返回


Details

详情----------Details----------

Node and edge data is stored as list within environments in graphs to save memory and speed up graph manipulations. When using getKEGGnodeData or getKEGGedgeData is called, the list is extracted out of the environment and returned.
节点和边的数据存储在图形环境,以节省内存,加快图形操作。当使用getKEGGnodeData或getKEGGedgeData被称为列表中提取出的环境和返回。


值----------Value----------

Either a list or single item of KEGGNode-class or KEGGEdge-class object(s).
无论是列表或单个项目KEGGNode-class或KEGGEdge-class对象(S)。


注意----------Note----------

These functions will be unified into 'KEGGnodeData' and 'KEGGnodeData<-' forms.
这些功能将被统一到“KEGGnodeData和KEGGnodeData < - 的形式。


作者(S)----------Author(s)----------


Jitao David Zhang <a href="mailto:jitao_david.zhang@roche.com">mailto:jitao_david.zhang@roche.com</a>



举例----------Examples----------


sfile <- system.file("extdata/hsa04010.xml",package="KEGGgraph")
gR <- parseKGML2Graph(sfile,expandGenes=TRUE)
getKEGGnodeData(gR,"hsa:4214")
getKEGGedgeData(gR,"hsa:4214~hsa:5605")

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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