R语言 KCsmart包 idPoints()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

idPoints(KCsmart)
idPoints()所属R语言包：KCsmart

                                         Identify points in sample point matrix plot
                                         确定采样点矩阵图中的点

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Identify points in sample point matrix plot
确定采样点矩阵图中的点


用法----------Usage----------


idPoints(spm, mode='pos', dev=2, chromosomes=NULL)



参数----------Arguments----------

参数：spm
The sample point matrix object of which points are to be identified  
这点是确定的采样点矩阵对象


参数：mode
Determines which points will be identified: mode='pos' will identify points in gained regions, mode='neg' will identify points in lost regions  
决定将确定哪些点：=POS的模式将确定分在获得区域，模式=负将确定分区域损失


参数：dev
The device on which the sample point matrix was plotted
采样点矩阵绘制设备


参数：chromosomes
If not all chromosomes contained in the sample point matrix were plotted (using the 'chromosomes' argument in the 'plot' command), the same chromosomes must be entered here as an argument
如果不是所有的采样点矩阵中的染色体被绘制（使用图命令染色体的说法），相同的染色体必须在这里输入作为一个参数


Details

详情----------Details----------

Using the mouse pointer points in a sample point matrix plot can be identified by left-clicking on the to-be-identified points. Right-clicking exits the selection and returns the selected points.
在采样点矩阵图使用鼠标点左键点击将要确定的点上可以识别。右击退出的选择，并返回所选点。


值----------Value----------

Returns a data.frame listing the the position and the KC score for each identified point.
返回一个数据框的位置和每一个确定的点的KC得分上市。


参数：KCscore
KCscore of the identified point
对已确定的点KCscore


参数：chromosome
Chromosome on which the identified point is located
位于染色体上确定点


参数：chromPosition
Position on the chromosome of the identified point
确定点的染色体上的位置


参数：colin
Co-linear location of the identified point (given the selected chromosomes)
确定点共线的位置（给选定的染色体）


作者（S）----------Author(s)----------


Jorma de Ronde



参见----------See Also----------

plot
plot


举例----------Examples----------


data(hsSampleData)
data(hsMirrorLocs)

#spm1mb &lt;- calcSpm(hsSampleData, hsMirrorLocs)[< -  calcSpm spm1mb（hsSampleData，hsMirrorLocs）]

#plot(spm1mb, type=1)[图（spm1mb，类型= 1）]
#idPoints(spm1mb)[idPoints（spm1mb）]

#x11()[X11（）]
#plot(spm1mb, chromosomes=c(1,2,5))[图（spm1mb，染色体= C（1,2,5））]
#idPoints(spm1mb, mode='neg', dev=3, chromosomes=c(1,2,5))[idPoints（spm1mb，模式=负，DEV = 3，染色体= C（1,2,5））]

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