R语言 ITALICS包 fromQuartetToSnp()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

fromQuartetToSnp(ITALICS)
fromQuartetToSnp()所属R语言包：ITALICS

                                        Compute the copy number of each SNP from its quartets intensities
                                         从其四重奏强度的计算每个SNP的拷贝数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function removes the LogRatio column of the snpInfo data.frame. Then compute the copy number of each SNP having its quartet intensities. And return the snpInfo data.frame with the newly computed LogRatio.
此功能消除了对数比列snpInfo数据框。然后计算每个SNP有四方强度的拷贝数。并返回新计算的对数比snpInfo数据框。


用法----------Usage----------


  fromQuartetToSnp(quartetInfo, snpInfo, cIntensity="quartetLogRatio", nLog=1)



参数----------Arguments----------

参数：quartetInfo
A table containing the quartet intensities and other quartet information.  It must have a column called : fsetid.
表四方强度和其他四方信息。它必须有称为列：fsetid。


参数：snpInfo
A table containing snp information.
一个表，其中包含的SNP信息。


参数：cIntensity
A vector containing the names of the quartet information to be aggregate. For example quartetLogRatio.  
四方信息的名称包含一个向量的总和。对于例如quartetLogRatio。


参数：nLog
The position of the field which will be named LogRatio in the snpInfo data.frame. For example if cIntensity = c("a", "b") and you want b to be considered as the LogRatio you should set nLog=2
将被命名为在snpInfo数据框数比外地的位置。例如，如果cIntensity = C（“A”，“B”）和你想B被认为是作为对数比，你应该设置nlog= 2


值----------Value----------

return the data.frame snpInfo with additionnal columns.
返回additionnal列的数据框snpInfo。


注意----------Note----------

People interested in tools dealing with array CGH analysis and DNA copy number analysis can
阵列比较基因组杂交分析和DNA拷贝数的分析与处理工具有兴趣的人可以


作者（S）----------Author(s)----------


Guillem Rigaill, <a href="mailto:italics@curie.fr">italics@curie.fr</a>.



源----------Source----------

Institut Curie, italics@curie.fr.
居里研究所，italics@curie.fr。

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注：
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