subsetIBSpectra(isobar)
subsetIBSpectra()所属R语言包:isobar
Subset IBSpectra objects
子集IBSpectra对象
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Returns an IBSpectra object which is a subset of the input, excluding or exclusively containing the peptides or proteins supplied.
返回一个IBSpectra对象,这是一个子集输入,不含或只含提供的多肽或蛋白质。
用法----------Usage----------
subsetIBSpectra(x, protein = NULL, peptide = NULL,
direction = "exclude",
specificity = c(REPORTERSPECIFIC, GROUPSPECIFIC, UNSPECIFIC), ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
IBSpectra object.
IBSpectra对象。
参数:protein
Protein group identifiers. Use protein.g to get protein group identifiers from protein database ACs.
蛋白质组标识符。使用protein.g从蛋白数据库的AC蛋白质组标识符。
参数:peptide
Peptide sequences.
多肽序列。
参数:direction
either 'include' or 'exclude'.
无论是“包括”或“排除”。
参数:specificity
When 'protein' is supplied: Which peptides should be selected? See specificities.
当蛋白质供给:应选择哪些肽?看到specificities。
参数:...
Further arguments passed to spectrumSel
进一步的参数传递spectrumSel
作者(S)----------Author(s)----------
Florian P Breitwieser
参见----------See Also----------
protein.g, spectrumSel, specificities
protein.g,spectrumSel,specificities
举例----------Examples----------
data(ibspiked_set1)
# get Keratin proteins[获得角蛋白的蛋白质]
keratin.proteins <- protein.g(proteinGroup(ibspiked_set1),"Keratin")
# exclude Keratin proteins[排除角质蛋白]
subsetIBSpectra(ibspiked_set1,protein=keratin.proteins,direction="exclude")
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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