R语言 isobar包 groupMemberPeptides()函数中文帮助文档(中英文对照)

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groupMemberPeptides(isobar)
groupMemberPeptides()所属R语言包：isobar

                                         Peptide info for protein group members
                                         肽蛋白质组的成员信息

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

For a given reporter protein group identifier, information on its peptides is returned. It contains information on how the peptides are shared and in which member they occur.
对于一个给定的记者蛋白质组标识符，其多肽的信息返回。它包含了关于如何肽共享，并在其中的成员，他们出现的信息。


用法----------Usage----------


groupMemberPeptides(x, reporter.protein.g, ordered.by.pos = TRUE, only.first.pos = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：x
ProteinGroup object
ProteinGroup对象


参数：reporter.protein.g
group reporter protein
组记者蛋白


参数：ordered.by.pos
if TRUE, start position of peptides in  proteins is exported and peptides are ordered by position  
如果为TRUE，蛋白质肽的起始位置是出口和多肽按位置排列


参数：only.first.pos
if TRUE, only first occurence of peptide in protein is reported  
如果为TRUE，只有第一次出现在蛋白质肽报道


值----------Value----------

list of two: [1] peptide.info: data.frame peptide specificity n.shared.groups n.shared.proteins start.pos [2] group.member.peptides: data.frame each column corresponds to a group member, and each row to a peptide
列表两种：[1] peptide.info：数据框肽特异性n.shared.groups n.shared.proteins start.pos [2] group.member.peptides：数据框每列对应一个组的成员，每个肽一行，


作者（S）----------Author(s)----------


Florian P Breitwieser



举例----------Examples----------


    data(ibspiked_set1)
    protein.group <- proteinGroup(ibspiked_set1)
    ceru.rat <- protein.g(protein.group,"CERU_RAT")
    groupMemberPeptides(protein.group,ceru.rat)

## find protein groups with members[＃找到蛋白质组与成员]
    t <- table(proteinGroupTable(protein.group)$reporter.protein)
    t[t>2]
    protein.g <- names(t)[t>2][1]
    groupMemberPeptides(protein.group,protein.g)

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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