R语言 inveRsion包 getClassif-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getClassif-methods(inveRsion)
getClassif-methods()所属R语言包：inveRsion

                                         Overall classification
                                         总体分类

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Classifies into inverted or non-inverted populations each chromosome in the sample.
倒或不倒的人群样本中的每个染色体分成。


用法----------Usage----------


getClassif(object, thBic, wROI, bin,geno,id)



参数----------Arguments----------

参数：object
inversionList. List of inversions obtained from a chromosome scan.   
inversionList。从染色体扫描获得的倒置名单。


参数：thBic
numeric. BIC threshold above which significant segments are chosen for the final classification  
numeric。 BIC的阈值以上的重要部分是选择最终的分类


参数：wROI
numeric. ROI number from the list to select classification  
numeric。投资回报率从列表选择分类


参数：bin
logic. Whether binary or continous classification is retrieved
logic。无论是二进制或连续分类检索


参数：geno
logic. Whether inversion genotype is retrieved
logic。是否反转基因型检索


参数：id
character. Vector of subject IDs
character。向量的主题标识


Details

详情----------Details----------

The overall classification of chromosomes into inverted and non-inverted populations is given by the majority vote of the classifications obtained for each trial segment in the ROI, with BIC greater than thBic.
成反相和非反相人口的整体分类的染色体是由多数票的每个试验段取得的投资回报率的分类，与BIC比thBic更大。


值----------Value----------

numeric. Vector with values between 0 and 1 representing membership to the non-inverted and inverted population respectively.
numeric。矢量值介于0和1分别代表会员向非倒置和倒置的人口。


方法----------Methods----------




signature(object = "inversionList")  for each of the inversions of the list, it returns the classification of each chromosome.
signature(object = "inversionList")列表中的每一个倒置的，它返回的每条染色体的分类。


作者（S）----------Author(s)----------



Alejandro Caceres <a href="mailto:acaceres@creal.cat">acaceres@creal.cat</a>




参见----------See Also----------

inversionList
inversionList


举例----------Examples----------


data(invList)
r<-getClassif(invList)
head(r)


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